RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480447.5

NOP56-212, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 651 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-212ENST00000480447 SLC25A20O43772 301 aa3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 SCO1O75880 301 aa3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 LINC00483Q53H64 154 aa3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 Q8NBF4 154 aa3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa3.55□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 C11orf86A6NJI1 115 aa3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 SPRR1AP35321 89 aa3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 C18orf32Q8TCD1 76 aa3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 YPEL4Q96NS1 127 aa3.54□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 A0A096LNJ9 63 aa3.53□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.53□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.53□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 TMEM223A0PJW6 202 aa3.53□□□□□ -1.84
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NOP56-212ENST00000480447 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.53□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.53□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 SVBPQ8N300 66 aa3.53□□□□□ -1.84
NOP56-212ENST00000480447 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.53□□□□□ -1.84
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NOP56-212ENST00000480447 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.53□□□□□ -1.84
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NOP56-212ENST00000480447 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
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NOP56-212ENST00000480447 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.52□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.52□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.52□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 LITAFQ99732 161 aa3.52□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.52□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 NDUFC2O95298 119 aa3.51□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 SMIM13P0DJ93 91 aa3.51□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 PLNP26678 52 aa3.51□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 NMUP48645 174 aa3.51□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.51□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 Q8NDZ9 215 aa3.51□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.5□□□□□ -1.85
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NOP56-212ENST00000480447 CFC1P0CG37 223 aa3.5□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 DDTP30046 118 aa3.5□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 PMCHL1Q16048 86 aa3.5□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.5□□□□□ -1.85
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NOP56-212ENST00000480447 NCR3O14931 201 aa3.49□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 HERVK_113P61574 105 aa3.49□□□□□ -1.85
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NOP56-212ENST00000480447 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.49□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 LIMD2Q9BT23 127 aa3.49□□□□□ -1.85
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NOP56-212ENST00000480447 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.48□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.47□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 COLCA2A8K830 154 aa3.47□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.47□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.47□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.47□□□□□ -1.85
NOP56-212ENST00000480447 J3QQQ9 107 aa3.46□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 LEPROTL1O95214 131 aa3.46□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 Q9BRP9 147 aa3.46□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 ERC2-IT1O76042 136 aa3.45□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 DPM2O94777 84 aa3.45□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 CD164Q04900 197 aa3.45□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 COPS9Q8WXC6 57 aa3.45□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.45□□□□□ -1.86
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NOP56-212ENST00000480447 SPRR1BP22528 89 aa3.44□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 SPANXCQ9NY87 97 aa3.44□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 H0Y8G0 127 aa3.43□□□□□ -1.86
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NOP56-212ENST00000480447 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.42□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.42□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 A0A0J9YXY3 114 aa3.41□□□□□ -1.86
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NOP56-212ENST00000480447 E9PLD3 99 aa3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 H7C2G1 150 aa3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 AKR1D1P51857 326 aa3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 TAL2Q16559 108 aa3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.41□□□□□ -1.86
NOP56-212ENST00000480447 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.4□□□□□ -1.87
NOP56-212ENST00000480447 HIST1H2BKO60814 126 aa3.4□□□□□ -1.87
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