RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 LINC00587B1AMM8 73 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 J3QQQ9 107 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 LINC00310P59036 64 aa6.08□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 HSBP1O75506 76 aa6.07□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 FABP4P15090 132 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.06□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 H7C2G1 150 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 SERF1AO75920 110 aa6.05□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 A0A0G2JQZ4 141 aa6.04□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 A0A0J9YXY3 114 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 DPM2O94777 84 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 LEPROTL1O95214 131 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 SNAPINO95295 136 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 NDUFC2O95298 119 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 PLNP26678 52 aa6.03□□□□□ -1.44
ACTB-209ENST00000473257 TRGC2P03986 189 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 Q1RN00 199 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 SVBPQ8N300 66 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.02□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 IGKCP01834 107 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 HERVK_113P61574 105 aa6.01□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 CFC1BP0CG36 223 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 SPRR1BP22528 89 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 NMUP48645 174 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 LITAFQ99732 161 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 LIMD2Q9BT23 127 aa6□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 M0R2T5 61 aa5.99□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 NDUFA5Q16718 116 aa5.99□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.99□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.98□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.98□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 C1orf195Q5TG92 126 aa5.97□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.97□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 USH2AO75445 5202 aa5.96□□□□□ -1.45
ACTB-209ENST00000473257 E9PLD3 99 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 COX7BP24311 80 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 TAL2Q16559 108 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 C6orf99Q4VX62 202 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.96□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 SSPOA2VEC9 5147 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 C5orf52A6NGY3 159 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 SMIM29Q86T20 159 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 SPANXCQ9NY87 97 aa5.95□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 PRO1933Q9H354 126 aa5.94□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.92□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.91□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 ZNF815PA8K554 130 aa5.91□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 CD164Q04900 197 aa5.91□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 AKR1D1P51857 326 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.9□□□□□ -1.46
ACTB-209ENST00000473257 TIMM17BO60830 172 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 S100A1P23297 94 aa5.89□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 COLCA2A8K830 154 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 Q6Q795 121 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.88□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 Q5XG85 94 aa5.87□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.86□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 A6NDN8 102 aa5.86□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 LINC01545Q5VT33 79 aa5.86□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.84□□□□□ -1.47
ACTB-209ENST00000473257 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.83□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GWB2 263 aa5.83□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BKO60814 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BJP06899 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 C3orf79P0CE67 100 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BOP23527 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BBP33778 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BDP58876 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BCP62807 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 PCP2Q8IVA1 136 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.82□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 TCL1BO95988 128 aa5.81□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 PET117Q6UWS5 81 aa5.81□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 ATOH7Q8N100 152 aa5.81□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.8□□□□□ -1.48
ACTB-209ENST00000473257 KRTDAPP60985 99 aa5.8□□□□□ -1.48
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