RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 SPINK1P00995 79 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 HERVK_113P61574 105 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.6□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 TIMM17BO60830 172 aa6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
HDLBP-232ENST00000470482 C5orf52A6NGY3 159 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 Q8N377 158 aa6.58□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 PET117Q6UWS5 81 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 CDIP1Q9H305 208 aa6.57□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 SPRR1BP22528 89 aa6.56□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 C3orf79P0CE67 100 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 S100A1P23297 94 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.55□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 S100A12P80511 92 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 MOBPQ13875 183 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 SPANXCQ9NY87 97 aa6.54□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 A0A0U1RQV1 116 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 NPC2P61916 151 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.53□□□□□ -1.36
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF815PA8K554 130 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 SLC25A20O43772 301 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.5□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 XP32Q5T750 250 aa6.49□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.48□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM29Q86T20 159 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.47□□□□□ -1.37
HDLBP-232ENST00000470482 C6orf99Q4VX62 202 aa6.45□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 IFITM1P13164 125 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 KRTDAPP60985 99 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 LCE2CQ5TA81 110 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 PCP2Q8IVA1 136 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.44□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 COX7BP24311 80 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 Q5XG85 94 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZVH6 145 aa6.43□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 CD164Q04900 197 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.42□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 ATOH7Q8N100 152 aa6.4□□□□□ -1.38
HDLBP-232ENST00000470482 A0A1B0GWB2 263 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.39□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.38□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 C20orf202A1L168 122 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 AKR1D1P51857 326 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 COPS9Q8WXC6 57 aa6.37□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 TAL2Q16559 108 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 Q1RN00 199 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 PRO1933Q9H354 126 aa6.36□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 A0A0G2JQZ4 141 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 A4D1N5 150 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 C1orf195Q5TG92 126 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 LIMD2Q9BT23 127 aa6.35□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 A6NDN8 102 aa6.34□□□□□ -1.39
HDLBP-232ENST00000470482 S100A6P06703 90 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 S100A2P29034 98 aa6.33□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00575Q6W349 94 aa6.32□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 H7C2G1 150 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 PCOTHQ58A44 107 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 C9orf92A6NGG3 77 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-232ENST00000470482 MT1HP80294 61 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 hADV29S1A0JD25 119 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 DLEU1O43261 78 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-232ENST00000470482 Q6ZQY7 126 aa6.25□□□□□ -1.41
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