RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 LRP2P98164 4655 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 NCR3O14931 201 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 PRLHP81277 87 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01545Q5VT33 79 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.15□□□□□ -1.75
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RABGEF1-206ENST00000461017 E9PLD3 99 aa4.14□□□□□ -1.75
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 SFTA2Q6UW10 78 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.14□□□□□ -1.75
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RABGEF1-206ENST00000461017 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0J9YXY3 114 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.12□□□□□ -1.75
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RABGEF1-206ENST00000461017 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2AP49459 152 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 HERVK_113P61574 105 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 NPC2P61916 151 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 LITAFQ99732 161 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 NMUP48645 174 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTDAPP60985 99 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 ATOH7Q8N100 152 aa4.11□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 TSPAN13O95857 204 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.1□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.1□□□□□ -1.75
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RABGEF1-206ENST00000461017 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF815PA8K554 130 aa4.08□□□□□ -1.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 CRYGAP11844 174 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 MTURNQ8N3F0 131 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 Q9BRP9 147 aa4.08□□□□□ -1.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV6-57P01721 117 aa4.07□□□□□ -1.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.05□□□□□ -1.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 SPANXCQ9NY87 97 aa4.05□□□□□ -1.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.04□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 SCGB1A1P11684 91 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR4Q16378 134 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00483Q53H64 154 aa4.03□□□□□ -1.76
RABGEF1-206ENST00000461017 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.03□□□□□ -1.76
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q8NBF4 154 aa4□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.99□□□□□ -1.77
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RABGEF1-206ENST00000461017 MOBPQ13875 183 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf99Q4VX62 202 aa3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 COX7BP24311 80 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
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