RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442645.1

GTF3AP5-201, Transcript of general transcription factor IIIA pseudogene 5, humanhuman

BASIC

Gene GTF3AP5, Length 697 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AP5-201ENST00000442645 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 MED13LQ71F56 2210 aa3.32□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 KALRNO60229 2985 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 PMAIP1Q13794 54 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 CACNA1HO95180 2353 aa3.31□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 C3orf84H3BNL1 204 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 C15orf56Q8N910 161 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 C7orf33Q8WU49 177 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 Q9BRP9 147 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.3□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 HTN3P15516 51 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 UBE2AP49459 152 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 SEC61GP60059 68 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 BDP1A6H8Y1 2624 aa3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 WDFY4Q6ZS81 3184 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 CR1P17927 2039 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 A0A1W2PNM2 257 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 KRTAP10-3P60369 221 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 B9D2Q9BPU9 175 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.28□□□□□ -1.88
GTF3AP5-201ENST00000442645 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 PSCAO43653 123 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 NDUFS5O43920 106 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 REG3GQ6UW15 175 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 Q8N9L7 120 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 LINC00208Q96KT6 92 aa3.27□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 ZNF292O60281 2723 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 H0Y9J4 135 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 CD164Q04900 197 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 Q6ZR54 194 aa3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 K7EQZ3 153 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 DEFB4AO15263 64 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 SPRR1BP22528 89 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 AKAP13Q12802 2813 aa3.25□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 MGAQ8IWI9 3026 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 A8MWP4 228 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 H0Y9P7 68 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 CASC2Q6XLA1 102 aa3.24□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 LRBAP50851 2863 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 TACC2O95359 2948 aa3.23□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 SPTA1P02549 2419 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 C16orf90A8MZG2 172 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 MOBPQ13875 183 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 IGFL1Q6UW32 110 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.22□□□□□ -1.89
GTF3AP5-201ENST00000442645 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 A0A087WSZ3 146 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.21□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 PSPHP1O15172 72 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 Q5VV11 94 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 SORL1Q92673 2214 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 ATMQ13315 3056 aa3.2□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.19□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 AKAP6Q13023 2319 aa3.19□□□□□ -1.9
GTF3AP5-201ENST00000442645 A8MUN3 132 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.4 ms