RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428482.5

HDLBP-216, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 OXTP01178 125 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.28□□□□□ -1.4
HDLBP-216ENST00000428482 A0A0U1RRA0 63 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 DAND5Q8N907 189 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 C1orf137Q5JT78 98 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 RNF213Q63HN8 5207 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 TAX1BP3O14907 124 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 IGKV2D-28P01615 120 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 Q8NDZ9 215 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 C9orf118A6NHY6 69 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 VPREB1P12018 145 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 BATFQ16520 125 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 RAB37Q96AX2 223 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 TMEM126AQ9H061 195 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-216ENST00000428482 M0R378 163 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 NPC2P61916 151 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2BP63146 152 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV7-43P04211 117 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 LINC01600Q96MT4 127 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 GAGE10A6NGK3 116 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV6-57P01721 117 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 C22orf24Q9Y442 160 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 H0Y9J4 135 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 K7ERJ3 54 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 TSPAN13O95857 204 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 LCE2CQ5TA81 110 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 COX6CP09669 75 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2V1Q13404 147 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1W2PPM0 123 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 H0YGX0 51 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 H3BUT2 72 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 PCP4P48539 62 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP10-8P60410 259 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 REG3GQ6UW15 175 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-216ENST00000428482 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00167Q96N53 147 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 MUC17Q685J3 4493 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 FABP2P12104 132 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 A0A1B0GX51 115 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 NCR3O14931 201 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 TRIAP1O43715 76 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 SPRR1AP35321 89 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 VAMP3Q15836 100 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 DIRC1Q969H9 104 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 PSMB2P49721 201 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 PRLHP81277 87 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 A0A087X002 238 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 PRYO14603 147 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 BCE1O60756 84 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 Q1RN00 199 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 H7C2G1 150 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 ZNF861PO60384 105 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-216ENST00000428482 K7EP34 96 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 TRACP01848 142 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 C6orf99Q4VX62 202 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 LST1O00453 97 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 SNCGO76070 127 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 LINC00575Q6W349 94 aa6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 K7ERU9 68 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 TCL1BO95988 128 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 ATXN8Q156A1 80 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 H3BQ85 93 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 UBE2AP49459 152 aa6.05□□□□□ -1.44
HDLBP-216ENST00000428482 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.05□□□□□ -1.44
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