RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00313P59037 77 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRU-204ENST00000428026 FAM168BA1KXE4 195 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRU-204ENST00000428026 IGLV6-57P01721 117 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRU-204ENST00000428026 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRU-204ENST00000428026 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.44□□□□□ -0.9
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PTPRU-204ENST00000428026 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
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PTPRU-204ENST00000428026 CHD6Q8TD26 2715 aa9.38□□□□□ -0.91
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PTPRU-204ENST00000428026 ZNF861PO60384 105 aa9.33□□□□□ -0.92
PTPRU-204ENST00000428026 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.33□□□□□ -0.92
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PTPRU-204ENST00000428026 J3QL48 77 aa9.3□□□□□ -0.92
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PTPRU-204ENST00000428026 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRU-204ENST00000428026 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.29□□□□□ -0.92
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PTPRU-204ENST00000428026 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRU-204ENST00000428026 CR1P17927 2039 aa9.27□□□□□ -0.93
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