RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 DNAL4O96015 105 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 GHRHP01286 108 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 C22orf24Q9Y442 160 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 EPM2AB3EWF7 344 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00575Q6W349 94 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 C7orf33Q8WU49 177 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00167Q96N53 147 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH2Q9P225 4427 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 COX7BP24311 80 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 HSPG2P98160 4391 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1B0GVY2 172 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 RTL8CO15255 209 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 SPRR1AP35321 89 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 TEN1Q86WV5 123 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 A0A087WYN8 130 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 hADV29S1A0JD25 119 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 FAM168BA1KXE4 195 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 J3QR89 54 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PNN7 141 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 K7ERU9 68 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 TNP2Q05952 138 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 ETDBQ3ZM63 59 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 REG3GQ6UW15 175 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 MTURNQ8N3F0 131 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 PKD1P98161 4303 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 B5MCH6 92 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 H0Y9J4 135 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 CHTF8P0CG12 524 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZRX8 168 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 DPH3Q96FX2 82 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2BP63146 152 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.15□□□□□ -1.42
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZQY7 126 aa6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 CDK2AP2O75956 126 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 PANO1I0J062 215 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N1X5 172 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 BCE1O60756 84 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 PDE6GP18545 87 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 Q6ZSA8 131 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 ACYP1P07311 99 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP10-2P60368 255 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 Q9BRP9 147 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-202ENST00000409024 UBE2AP49459 152 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.08□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 Q8N377 158 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 SPRR1BP22528 89 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 KRTAP10-1P60331 282 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 DSCR8Q96T75 97 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 CCKP06307 115 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-202ENST00000409024 PRLHP81277 87 aa6.04□□□□□ -1.44
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