RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405655.7

PRAME-205, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAME, Length 2,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-205ENST00000405655 LINC00167Q96N53 147 aa9□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 A0A1W2PNN7 141 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 CCDC179H3BU77 68 aa8.99□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 COX7BP24311 80 aa8.98□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 PANO1I0J062 215 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 TTC32Q5I0X7 151 aa8.97□□□□□ -0.97
PRAME-205ENST00000405655 Q6Q795 121 aa8.97□□□□□ -0.97
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PRAME-205ENST00000405655 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-205ENST00000405655 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.96□□□□□ -0.98
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.95□□□□□ -0.98
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PRAME-205ENST00000405655 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
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PRAME-205ENST00000405655 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.93□□□□□ -0.98
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PRAME-205ENST00000405655 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-205ENST00000405655 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-205ENST00000405655 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 ERC2-IT1O76042 136 aa8.89□□□□□ -0.99
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PRAME-205ENST00000405655 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.89□□□□□ -0.99
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PRAME-205ENST00000405655 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.88□□□□□ -0.99
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PRAME-205ENST00000405655 C14orf177Q52M58 125 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 LINC00846Q9NV44 126 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 PRLHP81277 87 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 Q6ZRX8 168 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.85□□□□□ -0.99
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PRAME-205ENST00000405655 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 SPRR1AP35321 89 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-205ENST00000405655 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 PRYO14603 147 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 REG3GQ6UW15 175 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
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PRAME-205ENST00000405655 Q8N377 158 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 CCKP06307 115 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 UBE2BP63146 152 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 TNP2Q05952 138 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 C5orf47Q569G3 176 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 A0A0G2JQZ4 141 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 Q6ZQT0 140 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 C1orf134Q5TEV5 83 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 RTL8CO15255 209 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-205ENST00000405655 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 ACYP1P07311 99 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 KRTAP10-2P60368 255 aa8.75□□□□□ -1.01
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PRAME-205ENST00000405655 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 DSCR8Q96T75 97 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 LINC00643Q86TS7 51 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 EPM2AB3EWF7 344 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 PKHD1P08F94 4074 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 A0A087WVE0 104 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 C3orf84H3BNL1 204 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-205ENST00000405655 IMUPQ9GZP8 106 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 J3KT08 172 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 SMIM29Q86T20 159 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-205ENST00000405655 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.69□□□□□ -1.02
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