RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326195.12

ABCF1-201, Transcript of ATP binding cassette subfamily F member 1, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene ABCF1, Length 3,481 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF1-201ENST00000326195 SPAG11BQ08648 103 aa6.98□□□□□ -1.29
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ABCF1-201ENST00000326195 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.97□□□□□ -1.29
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ABCF1-201ENST00000326195 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.97□□□□□ -1.29
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ABCF1-201ENST00000326195 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.86□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 Q6ZQY7 126 aa6.86□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 DIRC1Q969H9 104 aa6.86□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.86□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 C10orf25Q5T742 122 aa6.85□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.85□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.84□□□□□ -1.31
ABCF1-201ENST00000326195 A8MU10 97 aa6.84□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 PMAIP1Q13794 54 aa6.84□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 KIAA0087Q14695 138 aa6.83□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.83□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 PRYO14603 147 aa6.83□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 OCR1Q9BZK8 76 aa6.82□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 Q6ZRP5 223 aa6.82□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.82□□□□□ -1.32
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ABCF1-201ENST00000326195 NUPR2A6NF83 97 aa6.8□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 PSPHP1O15172 72 aa6.8□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 CASC10Q5T4H9 136 aa6.8□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 IGKV4-1P06312 121 aa6.8□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 PRR15Q8IV56 129 aa6.8□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.79□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 PSCAO43653 123 aa6.78□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 APLNQ9ULZ1 77 aa6.78□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 hDV103S1A0JD37 113 aa6.78□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 Q6ZRU5 148 aa6.78□□□□□ -1.32
ABCF1-201ENST00000326195 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.77□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 ERC2-IT1O76042 136 aa6.77□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.77□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.76□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 PDE6GP18545 87 aa6.76□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.76□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 H3BQ85 93 aa6.76□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 SYCNQ0VAF6 134 aa6.75□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 M0R378 163 aa6.75□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 IGLV6-57P01721 117 aa6.75□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 PRR4Q16378 134 aa6.75□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.74□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 PRR34Q9NV39 138 aa6.74□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 C3orf84H3BNL1 204 aa6.74□□□□□ -1.33
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ABCF1-201ENST00000326195 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.73□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 SMIM29Q86T20 159 aa6.72□□□□□ -1.33
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ABCF1-201ENST00000326195 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.71□□□□□ -1.33
ABCF1-201ENST00000326195 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.71□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 A8MUN3 132 aa6.7□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.69□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.69□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 UBE2BP63146 152 aa6.68□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 H3BNG1 76 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.67□□□□□ -1.34
ABCF1-201ENST00000326195 VPREB1P12018 145 aa6.67□□□□□ -1.34
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