RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288050.8

PDPR-201, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 9,255 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-201ENST00000288050 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.76□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 KLKP1Q107X0 134 aa6.76□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 C9orf92A6NGG3 77 aa6.76□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.75□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 A0A1B0GVX0 72 aa6.74□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 USP24Q9UPU5 2620 aa6.73□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.72□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.72□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 C16orf95Q9H693 158 aa6.72□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 C5orf42Q9H799 3197 aa6.71□□□□□ -1.33
PDPR-201ENST00000288050 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.71□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 LINC01546A6NGU7 62 aa6.71□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.71□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 A0A096LNJ9 63 aa6.71□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.71□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 A0A1W2PPR1 153 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 PRO0461Q9UI25 63 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 PCNTO95613 3336 aa6.7□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.69□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 SPINK7P58062 85 aa6.69□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 LINC00315P59091 139 aa6.68□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 Q8N1X5 172 aa6.68□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 H7BZZ5 65 aa6.66□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.66□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 HRES1P13985 223 aa6.66□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 A0A1B0GU33 70 aa6.65□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 PLAC4Q8WY50 150 aa6.65□□□□□ -1.34
PDPR-201ENST00000288050 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.65□□□□□ -1.35
PDPR-201ENST00000288050 H3BNG1 76 aa6.65□□□□□ -1.35
PDPR-201ENST00000288050 IGFL1Q6UW32 110 aa6.64□□□□□ -1.35
PDPR-201ENST00000288050 FAM168BA1KXE4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
PDPR-201ENST00000288050 M0R2T5 61 aa6.61□□□□□ -1.35
PDPR-201ENST00000288050 IGLV7-43P04211 117 aa6.61□□□□□ -1.35
PDPR-201ENST00000288050 Q75L30 129 aa6.6□□□□□ -1.35
PDPR-201ENST00000288050 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.57□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.57□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.57□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 CSAG1Q6PB30 78 aa6.57□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 C15orf56Q8N910 161 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 C10orf142B7Z368 130 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 ZNF861PO60384 105 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 Q6ZSA8 131 aa6.55□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.53□□□□□ -1.36
PDPR-201ENST00000288050 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.52□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.52□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 PRAC1Q96KF2 57 aa6.52□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.51□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.51□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 S4R3F8 94 aa6.5□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 CEP350Q5VT06 3117 aa6.48□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.37
PDPR-201ENST00000288050 Q8N377 158 aa6.45□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 ROMO1P60602 79 aa6.45□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 R4GN34 69 aa6.45□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 LITAFQ99732 161 aa6.45□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.45□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 Q8NAQ8 132 aa6.43□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.43□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 A0A0G2JQZ4 141 aa6.41□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 A0A1W2PNN7 141 aa6.41□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.4□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 SPRR4Q96PI1 79 aa6.4□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 BPTFQ12830 3046 aa6.4□□□□□ -1.38
PDPR-201ENST00000288050 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.38□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.37□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 OCR1Q9BZK8 76 aa6.36□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.36□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 ATRQ13535 2644 aa6.36□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 KRTAP10-11P60412 298 aa6.36□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 TNP2Q05952 138 aa6.34□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 STAB1Q9NY15 2570 aa6.34□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
PDPR-201ENST00000288050 BRCA2P51587 3418 aa6.34□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 A0A087WTM6 91 aa6.33□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 Q5VV11 94 aa6.31□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 MAST4O15021 2626 aa6.31□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.3□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.29□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.29□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 A0A1W2PNM2 257 aa6.29□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 M0QZ58 72 aa6.29□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 K7EIL1 84 aa6.28□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 PRR34Q9NV39 138 aa6.28□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.28□□□□□ -1.4
PDPR-201ENST00000288050 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.3 ms