RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPC1-201ENST00000273482 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.66□□□□□ -0.54
TRPC1-201ENST00000273482 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 C2orf48Q96LS8 159 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 ESRGQ1W209 222 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 Q8NAQ8 132 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 FBN2P35556 2912 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZRU5 148 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 LY6G6CO95867 125 aa11.61□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP11.6□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 C6orf48Q9UBA6 75 aa11.6□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 C14orf177Q52M58 125 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00208Q96KT6 92 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 PSPHP1O15172 72 aa11.59□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 KRTAP10-11P60412 298 aa11.56□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa11.55□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 SMIM29Q86T20 159 aa11.55□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 KIAA0087Q14695 138 aa11.54□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 IGKV4-1P06312 121 aa11.54□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 PLAC8L1A1L4L8 177 aa11.53□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.52□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 B9D2Q9BPU9 175 aa11.52□□□□□ -0.56
TRPC1-201ENST00000273482 A6NED7 52 aa11.52□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 H7BZZ5 65 aa11.52□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 KLKP1Q107X0 134 aa11.52□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 IGLV6-57P01721 117 aa11.51□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.5□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 PMAIP1Q13794 54 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 A0A087WSZ3 146 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 NUPR2A6NF83 97 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00474Q9P2X8 69 aa11.49□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00336Q6ZUF6 198 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 C7orf33Q8WU49 177 aa11.48□□□□□ -0.57
TRPC1-201ENST00000273482 HCG22E2RYF7 251 aa11.46□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 MXRA5Q9NR99 2828 aa11.46□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 CYSTM1Q9H1C7 97 aa11.45□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 K7EIL1 84 aa11.44□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 REG3GQ6UW15 175 aa11.44□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 LINC01556Q5JQF7 62 aa11.44□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00167Q96N53 147 aa11.44□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 PRR15LQ9BU68 103 aa11.44□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 VPREB1P12018 145 aa11.42□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 CASC2Q6XLA1 102 aa11.42□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TRPC1-201ENST00000273482 F8WDY8 70 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 H0Y9P7 68 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 Q8NBF4 154 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 C22orf24Q9Y442 160 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.39□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 H3BNG1 76 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 ERC2-IT1O76042 136 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 MDFIQ99750 246 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 PRLHP81277 87 aa11.37□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 Q9BRP9 147 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.36□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1B0GW54 56 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 hDV103S1A0JD37 113 aa11.35□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 PCOTHQ58A44 107 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZRP5 223 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZRX8 168 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa11.34□□□□□ -0.59
TRPC1-201ENST00000273482 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.33□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 SEC61GP60059 68 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.31□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 PRR34Q9NV39 138 aa11.3□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.29□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 WIPF1O43516 503 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 LINC00476Q8WZB0 136 aa11.28□□□□□ -0.6
TRPC1-201ENST00000273482 K7EQZ3 153 aa11.27□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.26□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 LIMD2Q9BT23 127 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 Q5XG85 94 aa11.25□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 TENM4Q6N022 2769 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 Q8N377 158 aa11.24□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.23□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.22□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 STAB2Q8WWQ8 2551 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.21□□□□□ -0.61
TRPC1-201ENST00000273482 OXTP01178 125 aa11.21□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 A8MUN3 132 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 FAM168BA1KXE4 195 aa11.2□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 Q8NDZ9 215 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 C15orf56Q8N910 161 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 CHTF8P0CG12 524 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 OCR1Q9BZK8 76 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PNM2 257 aa11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms