RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
TRPC1-201ENST00000273482 TM2D3Q9BRN9 247 aa11.66□□□□□ -0.54
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TRPC1-201ENST00000273482 C2orf48Q96LS8 159 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 ESRGQ1W209 222 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 Q8NAQ8 132 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa11.64□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 FBN2P35556 2912 aa11.62□□□□□ -0.55
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZRU5 148 aa11.62□□□□□ -0.55
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TRPC1-201ENST00000273482 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.31□□□□□ -0.6
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TRPC1-201ENST00000273482 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 Q8NDZ9 215 aa11.19□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 C15orf56Q8N910 161 aa11.18□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 CHTF8P0CG12 524 aa11.16□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 OCR1Q9BZK8 76 aa11.15□□□□□ -0.62
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
TRPC1-201ENST00000273482 A0A1W2PNM2 257 aa11.14□□□□□ -0.63
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