RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218348.7

USP11-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 11, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP11, Length 3,338 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11-201ENST00000218348 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.73□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 ESRGQ1W209 222 aa6.73□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 A8MU10 97 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 KIAA0087Q14695 138 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 Q8IZM0 81 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 COPS9Q8WXC6 57 aa6.72□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 A0A087WYN8 130 aa6.71□□□□□ -1.33
USP11-201ENST00000218348 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 Q8NDZ9 215 aa6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.71□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 Q6ZRU5 148 aa6.7□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 PRR15Q8IV56 129 aa6.7□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 LECT2O14960 151 aa6.7□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.69□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 PSPHP1O15172 72 aa6.68□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.67□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 Q6JHZ5 121 aa6.67□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 C22orf24Q9Y442 160 aa6.67□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.66□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.66□□□□□ -1.34
USP11-201ENST00000218348 PRR34Q9NV39 138 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C6orf99Q4VX62 202 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 B9D2Q9BPU9 175 aa6.65□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 CASC10Q5T4H9 136 aa6.63□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.63□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TGP01266 2768 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C8orf87E5RJ46 101 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 KMT2AQ03164 3969 aa6.62□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.61□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.61□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.6□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.6□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 C15orf56Q8N910 161 aa6.6□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 KLKP1Q107X0 134 aa6.59□□□□□ -1.35
USP11-201ENST00000218348 M0R378 163 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 H0YGX0 51 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 COX17Q14061 63 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 DNAH2Q9P225 4427 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.57□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 Q6ZRP5 223 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 H3BNG1 76 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.56□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 Q8N814 137 aa6.55□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 SYCNQ0VAF6 134 aa6.55□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 RYR2Q92736 4967 aa6.54□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 FAM168BA1KXE4 195 aa6.54□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.54□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 Q6ZQY7 126 aa6.53□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.53□□□□□ -1.36
USP11-201ENST00000218348 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 HAMPP81172 84 aa6.52□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 A8MUN3 132 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 RYR3Q15413 4870 aa6.51□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 VPREB1P12018 145 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 LINC00575Q6W349 94 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DIRC1Q969H9 104 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 IGLV6-57P01721 117 aa6.5□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 PSCAO43653 123 aa6.49□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 SCXQ7RTU7 201 aa6.49□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.49□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 M0R2N4 97 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 PRR4Q16378 134 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.48□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 COX7BP24311 80 aa6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 UBL5Q9BZL1 73 aa6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 NDUFC1O43677 76 aa6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
USP11-201ENST00000218348 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 C7orf33Q8WU49 177 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 Q6ZVQ6 151 aa6.45□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 C16orf90A8MZG2 172 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.44□□□□□ -1.38
USP11-201ENST00000218348 PKD1P98161 4303 aa6.43□□□□□ -1.38
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