RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619957.1

HOTTIP_3.1-201, humanhuman

BASIC

Gene HOTTIP_3, Length 337 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 IGKV2D-28P01615 120 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BJP06899 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BOP23527 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BBP33778 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PFN2P35080 140 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BDP58876 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BCP62807 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 COX17Q14061 63 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.28□□□□□ -1.88
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FABP4P15090 132 aa3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PRLHP81277 87 aa3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ERG28Q9UKR5 140 aa3.27□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TMEM238C9JI98 176 aa3.26□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 VPREB1P12018 145 aa3.26□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SFTA2Q6UW10 78 aa3.26□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TMEM126AQ9H061 195 aa3.26□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CDIP1Q9H305 208 aa3.26□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.26□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LPAP08519 4548 aa3.25□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.25□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 M0R378 163 aa3.25□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 RPL24P83731 157 aaKnown RBP3.25□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SVIPQ8NHG7 77 aa3.25□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.25□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.25□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 H0Y8G0 127 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LEPROTO15243 131 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 DPM2O94777 84 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 S100A1P23297 94 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PLNP26678 52 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LINC00158P58513 81 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HERV-K104P63124 156 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TPRXLQ17RH7 258 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 Q8NDZ9 215 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.24□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LINC00587B1AMM8 73 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 J3QQQ9 107 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 IGKCP01834 107 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SMIM13P0DJ93 91 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PET117Q6UWS5 81 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MUC2Q02817 5179 aa3.23□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 A0A0U1RRA0 63 aa3.22□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 E9PLD3 99 aa3.22□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 C3orf79P0CE67 100 aa3.22□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 CTAG1AP78358 180 aa3.22□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LINC01545Q5VT33 79 aa3.22□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SPRR4Q96PI1 79 aa3.22□□□□□ -1.89
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 A6NJY4 79 aa3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ATP6V1G1O75348 118 aa3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NMUP48645 174 aa3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 C4orf48Q5BLP8 95 aa3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 PRYO14603 147 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 NCR3O14931 201 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 HERVK_113P61574 105 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 DAND5Q8N907 189 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 Q8NBF4 154 aa3.2□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 A0A0J9YXY3 114 aa3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SPRR1AP35321 89 aa3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KRTDAPP60985 99 aa3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 LITAFQ99732 161 aa3.19□□□□□ -1.9
HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.19□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 130.8 ms