RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 CASC2Q6XLA1 102 aa14.27□□□□□ -0.13
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8N3U1 123 aa14.27□□□□□ -0.13
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PTPRJ-208ENST00000615445 Q8NAQ8 132 aa14.26□□□□□ -0.13
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PTPRJ-208ENST00000615445 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.25□□□□□ -0.13
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PTPRJ-208ENST00000615445 SVIPQ8NHG7 77 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 EPM2AB3EWF7 344 aa13.83□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 Q8NBF4 154 aa13.82□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC00476Q8WZB0 136 aa13.82□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 SMIM29Q86T20 159 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 STAB1Q9NY15 2570 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 FAM168BA1KXE4 195 aa13.8□□□□□ -0.2
PTPRJ-208ENST00000615445 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa13.79□□□□□ -0.2
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