RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 CELA1Q9UNI1 258 aa6.31□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 SPAG11BQ08648 103 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 JMJD1CQ15652 2540 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM126AQ9H061 195 aa6.29□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 KIAA0087Q14695 138 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 TTC32Q5I0X7 151 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR34Q9NV39 138 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.28□□□□□ -1.4
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.27□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WYN8 130 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 LECT2O14960 151 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00643Q86TS7 51 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 IMUPQ9GZP8 106 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 Q9HAA7 133 aa6.26□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0J9YWU9 116 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BQ85 93 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 KLK12Q9UKR0 248 aa6.25□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 NF1P21359 2839 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 USP17L23D6RBM5 183 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00167Q96N53 147 aa6.24□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 F8WDY8 70 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf56Q8N813 242 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.23□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 NCR3O14931 201 aa6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
EFTUD2-222ENST00000592408 ENHOQ6UWT2 76 aa6.21□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.21□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N814 137 aa6.21□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 PRYO14603 147 aa6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C22orf24Q9Y442 160 aa6.2□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP10-11P60412 298 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf99Q4VX62 202 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZTC4 211 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf48Q96LS8 159 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 RETNQ9HD89 108 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.19□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV6-57P01721 117 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf25Q5T742 122 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6JHZ5 121 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf223Q8N319 242 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 DIRC1Q969H9 104 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.18□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 hADV29S1A0JD25 119 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00575Q6W349 94 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 ATRQ13535 2644 aa6.17□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 CCKP06307 115 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 COL6A5A8TX70 2615 aa6.16□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.15□□□□□ -1.42
EFTUD2-222ENST00000592408 CUBNO60494 3623 aa6.15□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 M0R378 163 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE6GP18545 87 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 RMI2Q96E14 147 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.14□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.13□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.13□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 COX7BP24311 80 aa6.13□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 ESRGQ1W209 222 aa6.13□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.12□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.12□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.1 ms