RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588374.1

EFTUD2-211, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 524 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 C1orf137Q5JT78 98 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 ERG28Q9UKR5 140 aa4.21□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 LEPROTO15243 131 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 PLNP26678 52 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 C5orf52A6NGY3 159 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 S100A6P06703 90 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 C3orf79P0CE67 100 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM13P0DJ93 91 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 COX17Q14061 63 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00167Q96N53 147 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 C12orf57Q99622 126 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 FAT1Q14517 4588 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 GAGE10A6NGK3 116 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 J3QQQ9 107 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 OXTP01178 125 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SMIM6P0DI80 62 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTDAPP60985 99 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 HERVK_113P61574 105 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 HERV-K104P63124 156 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SFTA2Q6UW10 78 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 PET117Q6UWS5 81 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.18□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV7-43P04211 117 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 S100A12P80511 92 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01545Q5VT33 79 aa4.17□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC00587B1AMM8 73 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL24P83731 157 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 E9PLD3 99 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV2D-28P01615 120 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 VPREB1P12018 145 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 S100A2P29034 98 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 CTAG1AP78358 180 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 REG3GQ6UW15 175 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ATOH7Q8N100 152 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 DAND5Q8N907 189 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 Q8NDZ9 215 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 A6NJY4 79 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 NMUP48645 174 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 DIRC1Q969H9 104 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.14□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 A0A0J9YXY3 114 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 C20orf202A1L168 122 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 M0R378 163 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 NPC2P61916 151 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 LINC01600Q96MT4 127 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 HIST1H2BLQ99880 126 aa4.13□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM238C9JI98 176 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 H0Y9J4 135 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 NCR3O14931 201 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF861PO60384 105 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 BCE1O60756 84 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 MT1HL1P0DM35 61 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.12□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ZNF815PA8K554 130 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 UBE2AP49459 152 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 KRTAP10-8P60410 259 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 TMEM126AQ9H061 195 aa4.11□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-211ENST00000588374 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.1□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 231.6 ms