RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560777.5

RABGGTA-218, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RABGGTA, Length 1,197 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-218ENST00000560777 NMUP48645 174 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.39□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 LINC00587B1AMM8 73 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 ATOH7Q8N100 152 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 Q8NDZ9 215 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 VPREB1P12018 145 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 AKR1D1P51857 326 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 UBE2BP63146 152 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 LINC00167Q96N53 147 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 A0A0J9YXY3 114 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.35□□□□□ -1.23
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RABGGTA-218ENST00000560777 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 MYCBP2O75592 4640 aa7.35□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 DAND5Q8N907 189 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.34□□□□□ -1.23
RABGGTA-218ENST00000560777 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 GAGE10A6NGK3 116 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.33□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 ZNF815PA8K554 130 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.32□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 SCGB1D1O95968 90 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 IGLV7-43P04211 117 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 LITAFQ99732 161 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 TIMM17BO60830 172 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 PCP2Q8IVA1 136 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.3□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 M0R378 163 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 IGKV2D-28P01615 120 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.29□□□□□ -1.24
RABGGTA-218ENST00000560777 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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RABGGTA-218ENST00000560777 NPC2P61916 151 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 NCR3O14931 201 aa7.26□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 BCE1O60756 84 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGGTA-218ENST00000560777 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.26□□□□□ -1.25
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RABGGTA-218ENST00000560777 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 REG3GQ6UW15 175 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 DIRC1Q969H9 104 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 TMEM126AQ9H061 195 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 H0Y9J4 135 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
RABGGTA-218ENST00000560777 SPANXCQ9NY87 97 aa7.23□□□□□ -1.25
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RABGGTA-218ENST00000560777 Q6ZVH6 145 aa7.21□□□□□ -1.26
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RABGGTA-218ENST00000560777 IGLV6-57P01721 117 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 MT1HL1P0DM35 61 aa7.2□□□□□ -1.26
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RABGGTA-218ENST00000560777 UBE2AP49459 152 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 PRLHP81277 87 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 PYY3Q5JQD4 70 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.19□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 DLEU1O43261 78 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 KRTAP10-8P60410 259 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 SPATA45Q537H7 98 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 C14orf144Q96I85 54 aa7.18□□□□□ -1.26
RABGGTA-218ENST00000560777 VAMP8Q9BV40 100 aa7.18□□□□□ -1.26
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