RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548041.5

CS-211, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-211ENST00000548041 Q8NDZ9 215 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 C22orf24Q9Y442 160 aa5.31□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 J3QQQ9 107 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 SMIM13P0DJ93 91 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 LINC00158P58513 81 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 HERVK_113P61574 105 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 COX17Q14061 63 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 C1orf137Q5JT78 98 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 SFTA2Q6UW10 78 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 PET117Q6UWS5 81 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 E9PLD3 99 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 PLEKHB2Q96CS7 222 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.29□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 GAGE10A6NGK3 116 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 VPREB1P12018 145 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 HERV-K104P63124 156 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 ATOH7Q8N100 152 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 LINC00167Q96N53 147 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-211ENST00000548041 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.27□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 DAND5Q8N907 189 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 IGKV2D-28P01615 120 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 IGLV7-43P04211 117 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 S100A6P06703 90 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 S100A2P29034 98 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 NMUP48645 174 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.26□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 A0A0J9YXY3 114 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 C20orf202A1L168 122 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 OXTP01178 125 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 SVIPQ8NHG7 77 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 NCR3O14931 201 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 NPC2P61916 151 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 C5orf52A6NGY3 159 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 LINC00587B1AMM8 73 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 MT1HL1P0DM35 61 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.23□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 ZNF815PA8K554 130 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 TMEM238C9JI98 176 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 H0Y9J4 135 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 BCE1O60756 84 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 LITAFQ99732 161 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-211ENST00000548041 REG3GQ6UW15 175 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 LINC01600Q96MT4 127 aa5.21□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 M0R378 163 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 ZNF861PO60384 105 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 PRLHP81277 87 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 PCP2Q8IVA1 136 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 DIRC1Q969H9 104 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 TMEM126AQ9H061 195 aa5.2□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.19□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 TIMM17BO60830 172 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 UBE2AP49459 152 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 AKR1D1P51857 326 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 PRYO14603 147 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 SCGB1D1O95968 90 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.17□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 NDUFC2O95298 119 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 DDTP30046 118 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 KRTAP10-8P60410 259 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 SPANXCQ9NY87 97 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-211ENST00000548041 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-211ENST00000548041 SPRR1AP35321 89 aa5.15□□□□□ -1.59
CS-211ENST00000548041 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms