RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 ADAMTS12P58397 1594 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 TACC2O95359 2948 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 HTTP42858 3142 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0G2JND7 137 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 LINC00587B1AMM8 73 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 VAMP8Q9BV40 100 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIVEP1P15822 2718 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 MLH3Q9UHC1 1453 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 C5P01031 1676 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 DEFB112Q30KQ8 113 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 NDUFC1O43677 76 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 ASIPP42127 132 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 PSMG4Q5JS54 123 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAMD9Q5K651 1589 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 HERC2O95714 4834 aa-0.96□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 AKAP9Q99996 3911 aa-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.97□□□□□ -2.56
RNU6-377P-201ENST00000515965 ITPR3Q14573 2671 aa-0.97□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 ABCC2Q92887 1545 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 H7BZZ5 65 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 CCL22O00626 93 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNGT1P63211 74 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMCHL1Q16048 86 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 USH2AO75445 5202 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 LYSTQ99698 3801 aa-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP-0.98□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZZEF1O43149 2961 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARMS2P0C7Q2 107 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 LELP1Q5T871 98 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 BCORQ6W2J9 1755 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa-0.99□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-1□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 MPC2O95563 127 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 DNAH3Q8TD57 4116 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 NRXN1Q9ULB1 1477 aa-1□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 GNGT2O14610 69 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 SARNPP82979 210 aaKnown RBP-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLIP1P30622 1438 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 RGPD2P0DJD1 1756 aa-1.01□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 UQCRHP07919 91 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRGV9Q99603 122 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 MUC17Q685J3 4493 aa-1.02□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 C20orf202A1L168 122 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 HEPN1Q6WQI6 88 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-1.03□□□□□ -2.57
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-1.03□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIGD1BQ9P298 99 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 PREX1Q8TCU6 1659 aa-1.04□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 MT4P47944 62 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 WFDC13Q8IUB5 93 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPRR2FQ96RM1 72 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 PMCHL2Q9BQD1 86 aa-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-1.05□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 ATOX1O00244 68 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 MT-ATP8P03928 68 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 SERP2Q8N6R1 65 aa-1.06□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 DMXL1Q9Y485 3027 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAGI2Q86UL8 1455 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 CUBNO60494 3623 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALKQ9UM73 1620 aa-1.07□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 H0YGG7 62 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 HMGN3Q15651 99 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 AP4S1Q9Y587 144 aa-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.08□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM218A2RU14 115 aa-1.09□□□□□ -2.58
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.09□□□□□ -2.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.6 ms