RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510193.1

SH3BP2-216, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 407 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
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SH3BP2-216ENST00000510193 GAGE10A6NGK3 116 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
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SH3BP2-216ENST00000510193 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.52□□□□□ -1.21
SH3BP2-216ENST00000510193 ATP6V1G1O75348 118 aa7.51□□□□□ -1.21
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SH3BP2-216ENST00000510193 ERG28Q9UKR5 140 aa7.49□□□□□ -1.21
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SH3BP2-216ENST00000510193 IGKV2D-28P01615 120 aa7.47□□□□□ -1.21
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SH3BP2-216ENST00000510193 PLNP26678 52 aa7.45□□□□□ -1.22
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SH3BP2-216ENST00000510193 TMEM238C9JI98 176 aa7.44□□□□□ -1.22
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SH3BP2-216ENST00000510193 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.42□□□□□ -1.22
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SH3BP2-216ENST00000510193 C3orf79P0CE67 100 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 HERVK_113P61574 105 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.4□□□□□ -1.22
SH3BP2-216ENST00000510193 J3QQQ9 107 aa7.4□□□□□ -1.22
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SH3BP2-216ENST00000510193 LINC01545Q5VT33 79 aa7.4□□□□□ -1.22
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SH3BP2-216ENST00000510193 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.4□□□□□ -1.22
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SH3BP2-216ENST00000510193 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.35□□□□□ -1.23
SH3BP2-216ENST00000510193 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.35□□□□□ -1.23
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SH3BP2-216ENST00000510193 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.34□□□□□ -1.23
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SH3BP2-216ENST00000510193 NCR3O14931 201 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 SPRR1AP35321 89 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.33□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 MUC2Q02817 5179 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 C20orf202A1L168 122 aa7.32□□□□□ -1.24
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SH3BP2-216ENST00000510193 S100A2P29034 98 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 NPC2P61916 151 aa7.32□□□□□ -1.24
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SH3BP2-216ENST00000510193 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 S100A6P06703 90 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.31□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 MUC17Q685J3 4493 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ZNF815PA8K554 130 aa7.3□□□□□ -1.24
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SH3BP2-216ENST00000510193 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.3□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 LITAFQ99732 161 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP2-216ENST00000510193 CTAG1AP78358 180 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.27□□□□□ -1.25
SH3BP2-216ENST00000510193 TPRXLQ17RH7 258 aa7.26□□□□□ -1.25
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