RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497183.5

PRKCZ-223, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 3

Gene PRKCZ, Length 763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-223	ENST00000497183	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	FOXI1	Q12951	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	ORAOV1	Q8WV07	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	NDUFA1	O15239	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	CKS1B	P61024	79 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	HERV-K104	P63124	156 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q8IZM0	81 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A0J9YXY3	114 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183		M0R143	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	HSD52	Q0P140	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	BATF	Q16520	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	CXCL5	P42830	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	TAL2	Q16559	108 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A0U1RQV1	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A0U1RRA0	63 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	TIMM17B	O60830	172 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC00158	P58513	81 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	CEND1	Q8N111	149 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PRKCZ-223	ENST00000497183		A6NDN8	102 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	PFN2	P35080	140 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q6ZVH6	145 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A096LNI7	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183		A6NJY4	79 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183		F8WDY8	70 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	IFITM1	P13164	125 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	NPC2	P61916	151 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.51	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	FXYD2	P54710	66 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	COX17	Q14061	63 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	DAND5	Q8N907	189 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.5	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	LITAF	Q99732	161 aa		4.49	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183		A4D1N5	150 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.48	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.47	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.47	□□□□□ -1.69
PRKCZ-223	ENST00000497183	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.46	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183		A0A0B4J2C4	111 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183		K7ERJ3	54 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	CFC1	P0CG37	223 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183		Q6ZRP5	223 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PRKCZ-223	ENST00000497183	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.45	□□□□□ -1.7

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