RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495785.1

SRSF10-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF10, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10-215ENST00000495785 TMEM243Q9BU79 118 aa4.6□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 A0A087WYN8 130 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 F2Z2F3 143 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 H3BUT2 72 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 H7C1H1 209 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 J3QQQ9 107 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 P01737 135 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 KRTDAPP60985 99 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 Q5XG85 94 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 MANBALQ9NQG1 85 aa4.59□□□□□ -1.67
SRSF10-215ENST00000495785 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 PFN2P35080 140 aa4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 Q6ZRU5 148 aa4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 PGLYRP4Q96LB8 373 aa4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.58□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 GAS8-AS1O95177 125 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 COX6A2Q02221 97 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 C15orf56Q8N910 161 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 IMUPQ9GZP8 106 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.57□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 A0A1B0GWB2 263 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 UBE2L6O14933 153 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TRACP01848 142 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 CRYGAP11844 174 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 NMUP48645 174 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 PRELID3AQ96N28 172 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa4.56□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 SMIM13P0DJ93 91 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 BAGE3Q86Y29 109 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 GTSF1Q8WW33 167 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 RNF185Q96GF1 192 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 C20orf78Q9BR46 151 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 CNFNQ9BYD5 112 aa4.55□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TNXBP22105 4242 aa4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 VCYO14598 125 aa4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 FGF6P10767 208 aa4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 ETDBQ3ZM63 59 aa4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.53□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 LRP2P98164 4655 aa4.53□□□□□ -1.68
SRSF10-215ENST00000495785 A0A096LNI7 61 aa4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 SDHAF1A6NFY7 115 aa4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 SERF1AO75920 110 aa4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 C3orf79P0CE67 100 aa4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 XCL1P47992 114 aa4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 C7orf33Q8WU49 177 aa4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 LINC01600Q96MT4 127 aa4.53□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.52□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 H7C423 109 aa4.52□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 TSHBP01222 138 aa4.52□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 APCSP02743 223 aa4.52□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 A0A0A0MQY5 61 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 I3L3M4 83 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 COX8AP10176 69 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 COX7CP15954 63 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP10-8P60410 259 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 TEN1Q86WV5 123 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 CARD19Q96LW7 228 aa4.51□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 RNF213Q63HN8 5207 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 A8MWL6 223 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 SMKR1H3BMG3 65 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 LINC01545Q5VT33 79 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 PRR15Q8IV56 129 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.5□□□□□ -1.69
SRSF10-215ENST00000495785 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.49□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms