RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493607.1

SERBP1-208, Transcript of SERPINE1 mRNA binding protein 1, human

TSL 2

Gene SERBP1, Length 615 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERBP1-208	ENST00000493607	LINC00158	P58513	81 aa		13.89	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	PLN	P26678	52 aa		13.88	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	IGKV2D-28	P01615	120 aa		13.87	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	SCO1	O75880	301 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	UBE2A	P49459	152 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607		Q8NDZ9	215 aa		13.86	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	TMEM126A	Q9H061	195 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SERBP1-208	ENST00000493607		H0Y8G0	127 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	LEPROT	O15243	131 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	SMIM13	P0DJ93	91 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607		M0R378	163 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	ATP6V1G1	O75348	118 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	DPM2	O94777	84 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	CRYGA	P11844	174 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607		A0A087X002	238 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607		A0A0U1RRA0	63 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	FABP4	P15090	132 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	TMEM238	C9JI98	176 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	NMU	P48645	174 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	HERVK_113	P61574	105 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SERBP1-208	ENST00000493607	IGKC	P01834	107 aa		13.77	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	PRLH	P81277	87 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		13.76	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607		J3QQQ9	107 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BK	O60814	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BO	P23527	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BB	P33778	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BD	P58876	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BC	P62807	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		13.75	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	PRY	O14603	147 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		13.73	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	SPRR1A	P35321	89 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SERBP1-208	ENST00000493607	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		13.69	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607		E9PLD3	99 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	CTAG1A	P78358	180 aa		13.68	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		13.67	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	LPA	P08519	4548 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	NCR3	O14931	201 aa		13.66	□□□□□ -0.22
SERBP1-208	ENST00000493607	NDUFC2	O95298	119 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	S100A12	P80511	92 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	LINC01545	Q5VT33	79 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		13.64	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	PET117	Q6UWS5	81 aa		13.63	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	DAND5	Q8N907	189 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.62	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	RNF213	Q63HN8	5207 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607		A0A0J9YXY3	114 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	SPRR4	Q96PI1	79 aa		13.6	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		13.59	□□□□□ -0.23
SERBP1-208	ENST00000493607	TSPAN13	O95857	204 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	DDT	P30046	118 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	PRR4	Q16378	134 aa		13.58	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	IGLV6-57	P01721	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607		B5MCH6	92 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	TIMM17B	O60830	172 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	C3orf79	P0CE67	100 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERBP1-208	ENST00000493607	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	LITAF	Q99732	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	LINC00483	Q53H64	154 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		13.5	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607		Q6ZRX8	168 aa		13.49	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	SPANXC	Q9NY87	97 aa		13.47	□□□□□ -0.25
SERBP1-208	ENST00000493607	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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