RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486425.1

MUC4-222, Transcript of mucin 4, cell surface associated, human

TSL 4

Gene MUC4, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC4-222	ENST00000486425	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425		A0A1W2PPM0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425		K7ERJ3	54 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	LCE6A	A0A183	80 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	TSPAN13	O95857	204 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	CKS1B	P61024	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	RMI2	Q96E14	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425	HERC2	O95714	4834 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MUC4-222	ENST00000486425		H3BUT2	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425		K7EP34	96 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	NDUFC2	O95298	119 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	DAND5	Q8N907	189 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	FABP2	P12104	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	LINC00158	P58513	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	VAMP3	Q15836	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	PFN2	P35080	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	NPC2	P61916	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425		A0A0U1RRA0	63 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425		Q9HAA7	133 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	TRIAP1	O43715	76 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425		Q6ZRU5	148 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MUC4-222	ENST00000486425	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.84	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		M0QXV9	152 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	TCL1B	O95988	128 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	COX6C	P09669	75 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		Q1RN00	199 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		F8W1H4	67 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	LST1	O00453	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		Q6ZR54	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		Q8NDZ9	215 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		H3BMG7	143 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	VPREB1	P12018	145 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	PSMB2	P49721	201 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		Q6ZRP5	223 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.8	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425		H7C2G1	150 aa		4.79	□□□□□ -1.64
MUC4-222	ENST00000486425	TRAC	P01848	142 aa		4.79	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms