RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 SPINK14Q6IE38 97 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CELA1Q9UNI1 258 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 C3orf84H3BNL1 204 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 KRTAP1-1Q07627 177 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CASC2Q6XLA1 102 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 KLK9Q9UKQ9 250 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 MOBPQ13875 183 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM104AQ969W3 186 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV3-15P01624 115 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00158P58513 81 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CADP27708 2225 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 ANK2Q01484 3957 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 B9D2Q9BPU9 175 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 Q9BRP9 147 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 FAM215AQ9Y5M1 114 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CCL3L1P16619 93 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CCL18P55774 89 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 SCXQ7RTU7 201 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 COX7B2Q8TF08 81 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00208Q96KT6 92 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 S4R3C0 116 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PPR1 153 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 C6orf99Q4VX62 202 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CCL19Q99731 98 aa4.54□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 PLCE1Q9P212 2302 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 DNAJC13O75165 2243 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 IGKV4-1P06312 121 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV1-2P23083 117 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.53□□□□□ -1.68
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV1-8P0DP01 117 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 MUC7Q8TAX7 377 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 CR1P17927 2039 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 K7EQD1 137 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 COX6A2Q02221 97 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.52□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 NPBQ8NG41 125 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV1-44P01699 117 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-23P01764 117 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.51□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 PINLYPA6NC86 204 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00575Q6W349 94 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS13CQ709C8 3753 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 MUC4Q99102 2169 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 ZANQ9Y493 2812 aa4.5□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFA4O00483 81 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 TTTY12Q9BZ98 90 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCA1O95477 2261 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV1-47P01700 117 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 COX7BP24311 80 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 WFDC10AQ9H1F0 79 aa4.49□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 M0R2N4 97 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 ATP6V0E1O15342 81 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC01006Q8NI28 216 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GW54 56 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV1-46P01743 117 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3-53P01767 116 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-208ENST00000471759 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.46□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms