RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	TMEM223	A0PJW6	202 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	OXT	P01178	125 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	GAGE2E	Q4V326	116 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		5.2	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	NUPR1	O60356	82 aa		5.19	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128		M0QXV9	152 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5.18	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	FAM168B	A1KXE4	195 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	LINC00587	B1AMM8	73 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	DPM2	O94777	84 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	HERV-K104	P63124	156 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	ERG28	Q9UKR5	140 aa		5.17	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	ATP6V1G1	O75348	118 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	FABP4	P15090	132 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	HERVK_113	P61574	105 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
USP34-208	ENST00000467128		H0Y8G0	127 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	IGKC	P01834	107 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	NMU	P48645	174 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	5.15	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		5.15	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	LEPROT	O15243	131 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	AKR1D1	P51857	326 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	UBE2B	P63146	152 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	LINC01545	Q5VT33	79 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	PET117	Q6UWS5	81 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.14	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.13	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	PFN2	P35080	140 aa		5.13	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	C1orf137	Q5JT78	98 aa		5.13	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	REG3G	Q6UW15	175 aa		5.13	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	HERC1	Q15751	4861 aa		5.12	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128		E9PLD3	99 aa		5.12	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128		J3QQQ9	107 aa		5.12	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		5.12	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		5.11	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	VPREB1	P12018	145 aa		5.11	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		5.11	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		5.11	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5.11	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.11	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.11	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	C20orf202	A1L168	122 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	C3orf79	P0CE67	100 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	LINC00158	P58513	81 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128		H0Y9J4	135 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	ZNF861P	O60384	105 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	BCE1	O60756	84 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	SMIM13	P0DJ93	91 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	MT1HL1	P0DM35	61 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	LINC00167	Q96N53	147 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-208	ENST00000467128	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	TNXB	P22105	4242 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128		M0R378	163 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	TIMM17B	O60830	172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	KRTDAP	P60985	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128		A0A0J9YXY3	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	NDUFC2	O95298	119 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	S100A6	P06703	90 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	S100A2	P29034	98 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128		Q8NDZ9	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-208	ENST00000467128	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		5.05	□□□□□ -1.6

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