RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00167Q96N53 147 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00587B1AMM8 73 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 H0Y9J4 135 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 ATP6V1G1O75348 118 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKCP01834 107 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 GAGE10A6NGK3 116 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 LEPROTO15243 131 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0U1RRA0 63 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 VPREB1P12018 145 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF861PO60384 105 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 SMIM13P0DJ93 91 aa8.95□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 J3QQQ9 107 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 BCE1O60756 84 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 NMUP48645 174 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTAP10-8P60410 259 aa8.93□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKV2D-28P01615 120 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 S100A1P23297 94 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.92□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 PET117Q6UWS5 81 aa8.91□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 UBE2AP49459 152 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC01545Q5VT33 79 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 Q8NDZ9 215 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 TNXBP22105 4242 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 E9PLD3 99 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 M0R378 163 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM126AQ9H061 195 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 C3orf79P0CE67 100 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTDAPP60985 99 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 C20orf202A1L168 122 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 TMEM238C9JI98 176 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 NCR3O14931 201 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 DAND5Q8N907 189 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP1-205ENST00000466097 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 S100A12P80511 92 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 PRLHP81277 87 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.83□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A0J9YXY3 114 aa8.82□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 PRYO14603 147 aa8.82□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 AKR1D1P51857 326 aa8.81□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF815PA8K554 130 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 NDUFC2O95298 119 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 CRYGAP11844 174 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 S100A2P29034 98 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP1-205ENST00000466097 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 TIMM17BO60830 172 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 DDTP30046 118 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 NPC2P61916 151 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.77□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 S100A6P06703 90 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 A0A087X002 238 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 SPRR1AP35321 89 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 ATOH7Q8N100 152 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 LITAFQ99732 161 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 SPANXCQ9NY87 97 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP1-205ENST00000466097 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
SH3BP1-205ENST00000466097 IGLV6-57P01721 117 aa8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms