RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 PRR15Q8IV56 129 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 RNF213Q63HN8 5207 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SFT2D2O95562 160 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 S100ZQ8WXG8 99 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 TRGV9Q99603 122 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 FAT1Q14517 4588 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 LYRM1O43325 122 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 PITX3O75364 302 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 MT1HL1P0DM35 61 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 S100A11P31949 105 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 DPH3Q96FX2 82 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-212ENST00000434424 C9orf170A2RU37 121 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 SPINK4O60575 86 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 TIMM17BO60830 172 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 HYPMO75409 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 KRTAP5-8O75690 187 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 CST7O76096 145 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 IGHV3-30P01768 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 IGHV3-33P01772 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 MGST1P10620 155 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
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PTPRK-212ENST00000434424 ZNF846Q147U1 533 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 ODF3Q96PU9 254 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 OTORQ9NRC9 128 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 HIGD1AQ9Y241 93 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 A8MWV9 139 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 SSSCA1O60232 199 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 IL5P05113 134 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 ELOBQ15370 118 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRK-212ENST00000434424 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 GPX1P07203 203 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 LELP1Q5T871 98 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 PSENENQ9NZ42 101 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 NAT8BQ9UHF3 227 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 HIST1H2BKO60814 126 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 HIST1H2BJP06899 126 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 OR10J4P0C629 311 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 S100A10P60903 97 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 HBBP68871 147 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 LINC01600Q96MT4 127 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 K7ERJ3 54 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 NMBP08949 121 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 SFTA3P0C7M3 94 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 WFDC2Q14508 124 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 GGACTQ9BVM4 153 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 SPANXCQ9NY87 97 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 GSKIPQ9P0R6 139 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 A0A087WWC5 75 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 J3KT08 172 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 RPL35P42766 123 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 RHOHQ15669 191 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 NPVFQ9HCQ7 196 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 A0A087WX48 190 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 CRPP02741 224 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 FABP2P12104 132 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 Q0VG73 95 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 LINC00305Q7Z4B0 112 aa3.34□□□□□ -1.87
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PTPRK-212ENST00000434424 NMES1Q9C002 83 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-212ENST00000434424 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 M0R2P5 195 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 ARPC5O15511 151 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 AKR1C3P42330 323 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 NDUFA6P56556 154 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 Q1T7F1 81 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 PATE2Q6UY27 113 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 MGST2Q99735 147 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 C17orf112F2Z3M2 114 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 FGF7P21781 194 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 S100A12P80511 92 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 C10orf113Q5VZT2 155 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-212ENST00000434424 SIX6O95475 246 aa3.31□□□□□ -1.88
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