RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 H3BMG7 143 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 J3QQQ9 107 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF415Q09FC8 603 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 Q8N814 137 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 PRO0461Q9UI25 63 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0B4J2C4 111 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 IFITM1P13164 125 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB1P60022 68 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZSA8 131 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 C10orf126Q8N4M7 172 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 RAB37Q96AX2 223 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 VPS25Q9BRG1 176 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 JPT2Q9H910 190 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM238C9JI98 176 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 J3KRW8 73 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 INSP01308 110 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF56Q15929 161 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 COPS9Q8WXC6 57 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 FAM104AQ969W3 186 aa4.03□□□□□ -1.76
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PTPRK-211ENST00000429595 SPANXCQ9NY87 97 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 COTL1Q14019 142 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM170BQ5T4T1 132 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 GTSF1LQ9H1H1 148 aa4.02□□□□□ -1.77
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PTPRK-211ENST00000429595 H3BNG1 76 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01587Q99440 93 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 SIGMAR1Q99720 223 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.01□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0J9YXV3 536 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 LRCOL1A6NCL2 159 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRK-211ENST00000429595 K7ERJ3 54 aa4□□□□□ -1.77
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PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-33P01772 117 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 HERVK_113P63121 156 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 WFDC2Q14508 124 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 ERG28Q9UKR5 140 aa4□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-211ENST00000429595 HTN1P15515 57 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 SFTA2Q6UW10 78 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 Q75L30 129 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 TEN1Q86WV5 123 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 MTURNQ8N3F0 131 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-211ENST00000429595 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.99□□□□□ -1.77
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PTPRK-211ENST00000429595 A4D1N5 150 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 HERV-K104P63124 156 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 MIAQ16674 131 aa3.98□□□□□ -1.77
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PTPRK-211ENST00000429595 ETDBQ3ZM63 59 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 LINC01620Q4KN68 170 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 C16orf74Q96GX8 76 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.97□□□□□ -1.77
PTPRK-211ENST00000429595 H3BT86 120 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 K7EQD1 137 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRK-211ENST00000429595 APOMO95445 188 aa3.96□□□□□ -1.78
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