RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 VPS25Q9BRG1 176 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 KMT2AQ03164 3969 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 C9JAW5 83 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 ESRGQ1W209 222 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 RNF151Q2KHN1 245 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 Q8N3U1 123 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 CARD19Q96LW7 228 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 H0YGX0 51 aa6.75□□□□□ -1.33
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POLR1A-204ENST00000424089 UBE2WQ96B02 151 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV2D-28P01615 120 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf82Q6UX34 121 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.73□□□□□ -1.33
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POLR1A-204ENST00000424089 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 C2orf48Q96LS8 159 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 CLEC2BQ92478 149 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM126AQ9H061 195 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1B0GX51 115 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.69□□□□□ -1.34
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POLR1A-204ENST00000424089 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.69□□□□□ -1.34
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POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.68□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 C10orf25Q5T742 122 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf223Q8N319 242 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1A-204ENST00000424089 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.67□□□□□ -1.34
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POLR1A-204ENST00000424089 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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POLR1A-204ENST00000424089 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.66□□□□□ -1.34
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POLR1A-204ENST00000424089 C15orf56Q8N910 161 aa6.64□□□□□ -1.35
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POLR1A-204ENST00000424089 ACYP1P07311 99 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 SYCNQ0VAF6 134 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.62□□□□□ -1.35
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POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZRU5 148 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00167Q96N53 147 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 CDIP1Q9H305 208 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087WYN8 130 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 NCR3O14931 201 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 M0R378 163 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 LECT2O14960 151 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 GHRHP01286 108 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 PCP4P48539 62 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 Q8N814 137 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1A-204ENST00000424089 Q9HAA7 133 aa6.59□□□□□ -1.35
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POLR1A-204ENST00000424089 PKHD1P08F94 4074 aa6.59□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 C6orf99Q4VX62 202 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 VPREB1P12018 145 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00575Q6W349 94 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 Q8NDZ9 215 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 USP17L23D6RBM5 183 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 M0R2N4 97 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 RTL8CO15255 209 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 DIRC1Q969H9 104 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 C22orf24Q9Y442 160 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1A-204ENST00000424089 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.55□□□□□ -1.36
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