RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651		F2Z2F3	143 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC00614	P0C842	121 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	G0S2	P27469	103 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCL20	P78556	96 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	COX19	Q49B96	90 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.7	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMKR1	H3BMG3	65 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRLH	P81277	87 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	DLEU1	O43261	78 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2A	P49459	152 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	BATF	Q16520	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q8NBF4	154 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NIF3L1-206	ENST00000416651	C20orf202	A1L168	122 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	PRY	O14603	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651		K7EN84	100 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	VCY	O14598	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTDAP	P60985	99 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q8N377	158 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	FCER1G	P30273	86 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q6ZN92	141 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	LINC01551	Q86U37	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	GNG4	P50150	75 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	SERF1A	O75920	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0A0MQY5	61 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A0U1RRA0	63 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	HSBP1	O75506	76 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	LAMTOR2	Q9Y2Q5	125 aa		4.59	□□□□□ -1.67
NIF3L1-206	ENST00000416651	HBB	P68871	147 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	VAMP3	Q15836	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651		Q8NDZ9	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651		M0R378	163 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	NEB	P20929	6669 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651		K7ERU9	68 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	SPINK1	P00995	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	MT2A	P02795	61 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NIF3L1-206	ENST00000416651	CKS1B	P61024	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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