RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.78□□□□□ -0.52
ACTB-201ENST00000331789 M0QXV9 152 aa11.77□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 RMI2Q96E14 147 aa11.77□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 USP17L23D6RBM5 183 aa11.76□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 SYCNQ0VAF6 134 aa11.76□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 CARD19Q96LW7 228 aa11.76□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.76□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 F8WDY8 70 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 LINC01600Q96MT4 127 aa11.75□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 TMEM126AQ9H061 195 aa11.74□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa11.73□□□□□ -0.53
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ACTB-201ENST00000331789 TRACP01848 142 aa11.73□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 SLPIP03973 132 aa11.73□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 PPDPFLQ8WWR9 84 aa11.73□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 A0A087WYN8 130 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 H0YGX0 51 aa11.72□□□□□ -0.53
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ACTB-201ENST00000331789 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 GAGE2DQ9UEU5 116 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 NUPR2A6NF83 97 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 H3BT86 120 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 VPS25Q9BRG1 176 aa11.72□□□□□ -0.53
ACTB-201ENST00000331789 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
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ACTB-201ENST00000331789 DNAH1Q9P2D7 4330 aa11.7□□□□□ -0.54
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ACTB-201ENST00000331789 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-201ENST00000331789 IGLV6-57P01721 117 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-201ENST00000331789 VPREB1P12018 145 aa11.68□□□□□ -0.54
ACTB-201ENST00000331789 LYSTQ99698 3801 aa11.68□□□□□ -0.54
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ACTB-201ENST00000331789 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa11.67□□□□□ -0.54
ACTB-201ENST00000331789 C6orf99Q4VX62 202 aa11.66□□□□□ -0.54
ACTB-201ENST00000331789 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
ACTB-201ENST00000331789 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.65□□□□□ -0.54
ACTB-201ENST00000331789 DNAL4O96015 105 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 C22orf24Q9Y442 160 aa11.63□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 PSCAO43653 123 aa11.62□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 DNAH7Q8WXX0 4024 aa11.61□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 TENM2Q9NT68 2774 aa11.61□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 M0R378 163 aa11.61□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.61□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.6□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.6□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa11.59□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 Q8N814 137 aa11.59□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
ACTB-201ENST00000331789 GAGE2BQ13066 116 aa11.58□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.58□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 LINC00575Q6W349 94 aa11.56□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 LINC00167Q96N53 147 aa11.56□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GX51 115 aa11.56□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 TTC32Q5I0X7 151 aa11.56□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 STARD9Q9P2P6 4700 aa11.56□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 FAM168BA1KXE4 195 aa11.55□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa11.54□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.54□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 DIRC1Q969H9 104 aa11.54□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 CDIP1Q9H305 208 aa11.54□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 ORMDL1Q9P0S3 153 aa11.54□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 C7orf33Q8WU49 177 aa11.53□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.53□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 M0R2N4 97 aa11.52□□□□□ -0.56
ACTB-201ENST00000331789 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.52□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 hADV29S1A0JD25 119 aa11.52□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa11.51□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 COX7BP24311 80 aa11.5□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.5□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 SNCGO76070 127 aa11.5□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 C14orf177Q52M58 125 aa11.48□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 A0A096LNI7 61 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 SIGMAR1Q99720 223 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.47□□□□□ -0.57
ACTB-201ENST00000331789 A0A1B0GV72 72 aa11.45□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa11.45□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa11.45□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 FBN3Q75N90 2809 aa11.44□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa11.44□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 INAFM2P0DMQ5 153 aa11.44□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.43□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 Q6ZQY7 126 aa11.43□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 LINC00528Q8N1L1 170 aa11.43□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 C14orf132Q9NPU4 83 aa11.43□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 VPS13DQ5THJ4 4388 aa11.43□□□□□ -0.58
ACTB-201ENST00000331789 C16orf90A8MZG2 172 aa11.43□□□□□ -0.58
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