RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 Q1RN00 199 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 TTC32Q5I0X7 151 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.71□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPAN13O95857 204 aa6.7□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 COX6CP09669 75 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 C15orf56Q8N910 161 aa6.69□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EP34 96 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 PSCAO43653 123 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 SYCNQ0VAF6 134 aa6.68□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.67□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 USP17L23D6RBM5 183 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.67□□□□□ -1.34
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RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZRU5 148 aa6.66□□□□□ -1.34
RABGGTB-201ENST00000319942 C14orf177Q52M58 125 aa6.65□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.65□□□□□ -1.35
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RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2D-28P01615 120 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 CASC10Q5T4H9 136 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM126AQ9H061 195 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 F8W1H4 67 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BMG7 143 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIAP1O43715 76 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 DNHD1Q96M86 4753 aa6.62□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 LECT2O14960 151 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 ATXN8Q156A1 80 aa6.61□□□□□ -1.35
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RABGGTB-201ENST00000319942 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.61□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf84H3BNL1 204 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TCL1BO95988 128 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 H0YGX0 51 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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RABGGTB-201ENST00000319942 M0R2N4 97 aa6.59□□□□□ -1.36
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RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZRP5 223 aa6.59□□□□□ -1.36
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RABGGTB-201ENST00000319942 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.59□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 COL7A1Q02388 2944 aa6.59□□□□□ -1.36
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RABGGTB-201ENST00000319942 SNCGO76070 127 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R378 163 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 LY6G6CO95867 125 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 NCR3O14931 201 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 GAGE2BQ13066 116 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC2BQ92478 149 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 LST1O00453 97 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV6-57P01721 117 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 WFDC2Q14508 124 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC01620Q4KN68 170 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZR54 194 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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RABGGTB-201ENST00000319942 VPREB1P12018 145 aa6.54□□□□□ -1.36
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RABGGTB-201ENST00000319942 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 FBN3Q75N90 2809 aa6.54□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 C9JAW5 83 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 TRACP01848 142 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8NDZ9 215 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 M0QXV9 152 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A20O43772 301 aa6.53□□□□□ -1.36
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.53□□□□□ -1.36
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RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GX51 115 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-201ENST00000319942 C16orf90A8MZG2 172 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.52□□□□□ -1.37
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-201ENST00000319942 DNAL4O96015 105 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-201ENST00000319942 C6orf99Q4VX62 202 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-201ENST00000319942 MTURNQ8N3F0 131 aa6.51□□□□□ -1.37
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.51□□□□□ -1.37
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