RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A087WTM6 91 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TSPAN13O95857 204 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PPM0 123 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAMP3Q15836 100 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARD19Q96LW7 228 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF151Q2KHN1 245 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FABP2P12104 132 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLPIP03973 132 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H7C2G1 150 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NDUFC2O95298 119 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGKV2D-28P01615 120 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q1RN00 199 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C14orf177Q52M58 125 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q8N814 137 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKD1P98161 4303 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TLX1NBP0CAT3 122 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC00337Q8N6G1 96 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP10-2P60368 255 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LYRM7Q5U5X0 104 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPCS1Q9Y6A9 102 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 K7EP34 96 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSMB2P49721 201 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 XAGE1AQ9HD64 81 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAGE10A6NGK3 116 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UBE2V1Q13404 147 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q6ZRP5 223 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1B0GVY2 172 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q8NDZ9 215 aa13.15□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAGE2EQ4V326 116 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRIAP1O43715 76 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LINC01620Q4KN68 170 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR13C6PQ8NH95 151 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKHD1P08F94 4074 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NCR3O14931 201 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COX6CP09669 75 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL28P46779 137 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPREB1P12018 145 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TMEM126AQ9H061 195 aa13.08□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TCL1BO95988 128 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SMIM11BQ8TCY0 68 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 S100A7L2Q5SY68 101 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GAGE2BQ13066 116 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H3BMG7 143 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLV6-57P01721 117 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKIGQ9Y2B9 76 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 M0R378 163 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATXN8Q156A1 80 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C16orf90A8MZG2 172 aa13□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLEC2BQ92478 149 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A096LNI7 61 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP10-1P60331 282 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LST1O00453 97 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SDIM1Q6ZPB5 146 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H0YGX0 51 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM168BA1KXE4 195 aa12.96□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CBY1Q9Y3M2 126 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F8W1H4 67 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHTF8P0CG12 524 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C7orf33Q8WU49 177 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRO0461Q9UI25 63 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PANO1I0J062 215 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C6orf99Q4VX62 202 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM30AQ9NZY2 134 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAH8Q96JB1 4490 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM218AQ96MZ4 157 aa12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms