RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.31□□□□□ -0.28
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PPM0 123 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAMP3Q15836 100 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARD19Q96LW7 228 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAH11Q96DT5 4516 aa13.25□□□□□ -0.29
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PKD1P98161 4303 aa13.2□□□□□ -0.3
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHTF8P0CG12 524 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C7orf33Q8WU49 177 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRO0461Q9UI25 63 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PANO1I0J062 215 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C6orf99Q4VX62 202 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM218AQ96MZ4 157 aa12.91□□□□□ -0.34
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