RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 Q9H8V8 135 aa14.75□□□□□ -0.05
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SGMS1-210ENST00000619438 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-210ENST00000619438 ERG28Q9UKR5 140 aa14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-210ENST00000619438 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
SGMS1-210ENST00000619438 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.74□□□□□ -0.05
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SGMS1-210ENST00000619438 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.46□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 RTL8CO15255 209 aa14.45□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 CXCL5P42830 114 aa14.45□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 TTC32Q5I0X7 151 aa14.45□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 KIAA0087Q14695 138 aa14.44□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD29Q8N6D5 301 aa14.44□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 PRR34Q9NV39 138 aa14.44□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.44□□□□□ -0.1
SGMS1-210ENST00000619438 Q8N3U1 123 aa14.43□□□□□ -0.1
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