RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576513.2

SLC12A4-218, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 5

Gene SLC12A4, Length 412 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-218ENST00000576513 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa9.02□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 APOMO95445 188 aa9.02□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 HERV-K104P63124 156 aa9.02□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.01□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 GAGE12HA6NDE8 117 aa9.01□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 HSD52Q0P140 79 aa9.01□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.01□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.01□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 Q8IZM0 81 aa9.01□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 COX7B2Q8TF08 81 aa9.01□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 M0R143 59 aa9□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 TIMM17BO60830 172 aa9□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 RMI2Q96E14 147 aa9□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 C1orf43Q9BWL3 253 aa9□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 A0A0J9YXY3 114 aa8.99□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 MALP21145 153 aa8.99□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 TNP2Q05952 138 aa8.99□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 C6orf223Q8N319 242 aa8.99□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.99□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 COX11Q9Y6N1 276 aa8.99□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.98□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 CXCL5P42830 114 aa8.98□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.98□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 Q6ZVH6 145 aa8.98□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 TMEM238C9JI98 176 aa8.97□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 PRSS2P07478 247 aa8.97□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 KIAA0087Q14695 138 aa8.97□□□□□ -0.97
SLC12A4-218ENST00000576513 TM2D2Q9BX73 214 aa8.97□□□□□ -0.97
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SLC12A4-218ENST00000576513 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.96□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 Q8N1X5 172 aa8.96□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 HIST1H4GQ99525 98 aa8.96□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.96□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.95□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 TTC32Q5I0X7 151 aa8.95□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 CFAP161Q6P656 301 aa8.95□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 CEND1Q8N111 149 aa8.95□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.95□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.95□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 HSPG2P98160 4391 aa8.95□□□□□ -0.98
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SLC12A4-218ENST00000576513 SPANXCQ9NY87 97 aa8.94□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 IFITM1P13164 125 aa8.93□□□□□ -0.98
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SLC12A4-218ENST00000576513 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.91□□□□□ -0.98
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SLC12A4-218ENST00000576513 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.9□□□□□ -0.98
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SLC12A4-218ENST00000576513 A6NJY4 79 aa8.9□□□□□ -0.98
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SLC12A4-218ENST00000576513 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.9□□□□□ -0.98
SLC12A4-218ENST00000576513 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.89□□□□□ -0.99
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SLC12A4-218ENST00000576513 C15orf56Q8N910 161 aa8.88□□□□□ -0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.88□□□□□ -0.99
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SLC12A4-218ENST00000576513 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.86□□□□□ -0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 EPM2AB3EWF7 344 aa8.86□□□□□ -0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.85□□□□□ -0.99
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SLC12A4-218ENST00000576513 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.85□□□□□ -0.99
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SLC12A4-218ENST00000576513 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.85□□□□□ -0.99
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SLC12A4-218ENST00000576513 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
SLC12A4-218ENST00000576513 USP17L23D6RBM5 183 aa8.83□□□□□ -1
SLC12A4-218ENST00000576513 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.83□□□□□ -1
SLC12A4-218ENST00000576513 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.83□□□□□ -1
SLC12A4-218ENST00000576513 A4D1N5 150 aa8.82□□□□□ -1
SLC12A4-218ENST00000576513 PFN2P35080 140 aa8.82□□□□□ -1
SLC12A4-218ENST00000576513 KRTAP10-2P60368 255 aa8.82□□□□□ -1
SLC12A4-218ENST00000576513 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.82□□□□□ -1
SLC12A4-218ENST00000576513 C14orf177Q52M58 125 aa8.82□□□□□ -1
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