RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565589.5

RNPS1-215, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 2

Gene RNPS1, Length 666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-215	ENST00000565589	PRELID3A	Q96N28	172 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	MAP1LC3A	Q9H492	121 aa		5.02	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	NPY	P01303	97 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	AMELX	Q99217	191 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	C22orf24	Q9Y442	160 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589		F8VRH5	84 aa		5	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	BCE1	O60756	84 aa		5	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		5	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589		Q8N8P6	123 aa		5	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	C2orf82	Q6UX34	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	CTDSP1	Q9GZU7	261 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	LPA	P08519	4548 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	MUC2	Q02817	5179 aa		4.99	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	MT-ND4L	P03901	98 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
RNPS1-215	ENST00000565589	LOC389332	A0A1B0GUA5	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589		C9JQL5	133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	TSPAN13	O95857	204 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	UBE2A	P49459	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	LINC00173	Q6ZV60	143 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	LINC00167	Q96N53	147 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589		H3BRM9	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	ATP5L	O75964	103 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	COX17	Q14061	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589		A0A087X002	238 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	COX19	Q49B96	90 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RNPS1-215	ENST00000565589	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	RAB14	P61106	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	LINC01546	A6NGU7	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	PMVK	Q15126	192 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	CST9L	Q9H4G1	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	S100P	P25815	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	RAB5B	P61020	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	CBLN2	Q8IUK8	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	PLEKHB2	Q96CS7	222 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	SMCO4	Q9NRQ5	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589		A0A1B0GVG6	124 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	S100A12	P80511	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	UQCC3	Q6UW78	93 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	FA2H	Q7L5A8	372 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	SPINK1	P00995	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNPS1-215	ENST00000565589	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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