RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-229ENST00000551936 DIRC1Q969H9 104 aa8.78□□□□□ -1
CS-229ENST00000551936 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 PRSS2P07478 247 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 Q8IZM0 81 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 TOMM6Q96B49 74 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 TIMM17AQ99595 171 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.77□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 LPAP08519 4548 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 RNF213Q63HN8 5207 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 H0Y9J4 135 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 G0S2P27469 103 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.76□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 CKS1BP61024 79 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 HERVK_113P63121 156 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 UBE2BP63146 152 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 SEC11AP67812 179 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.75□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 ERASQ7Z444 233 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.74□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 C22orf24Q9Y442 160 aa8.72□□□□□ -1.01
CS-229ENST00000551936 LINC01546A6NGU7 62 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 F8VRH5 84 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 ATP6V1G1O75348 118 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.71□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.7□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 CXCL5P42830 114 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 COX19Q49B96 90 aa8.69□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 LINC01549A6NIU2 74 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 NUPR1O60356 82 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.68□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 ZNF861PO60384 105 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 S100A1P23297 94 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 COX7B2Q8TF08 81 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 YPEL4Q96NS1 127 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 CST9LQ9H4G1 147 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 SCO1O75880 301 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-229ENST00000551936 SPINK8P0C7L1 97 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 PMVKQ15126 192 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 FA2HQ7L5A8 372 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 LINC00167Q96N53 147 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 RAB5BP61020 215 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 A0A096LNJ9 63 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 BCE1O60756 84 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 IGLC3P0DOY3 106 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 COLCA2A8K830 154 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 H3BRM9 83 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-229ENST00000551936 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 LINC00614P0C842 121 aa8.58□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 GAGE10A6NGK3 116 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.57□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 A0A087X002 238 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 ATP5LO75964 103 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 NDUFA6P56556 154 aa8.56□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 TRGC2P03986 189 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 PFN2P35080 140 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.55□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 HBDP02042 147 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 PMCHL1Q16048 86 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 PRR4Q16378 134 aa8.54□□□□□ -1.04
CS-229ENST00000551936 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 IGKV2D-28P01615 120 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 CRYGAP11844 174 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 VPREB1P12018 145 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 ERG28Q9UKR5 140 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 C11orf86A6NJI1 115 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 TSPAN13O95857 204 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 UBE2AP49459 152 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 COX17Q14061 63 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 BAGE3Q86Y29 109 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.49□□□□□ -1.05
CS-229ENST00000551936 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.3 ms