RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.71□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 RAB37Q96AX2 223 aa3.71□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TMEM101Q96IK0 257 aa3.71□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa3.71□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 PRO0255Q9UI72 69 aa3.71□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 A0A0J9YXY3 114 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 F5H768 121 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 H3BUT2 72 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-30P01768 117 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 DAD1P61803 113 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 HERVK_113P63121 156 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 SMAGPQ0VAQ4 97 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 VAMP3Q15836 100 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 HIVEP1P15822 2718 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 A0A1W2PPM0 123 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 G3V4G9 280 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 UBE2L6O14933 153 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 ATP5G1P05496 136 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 CHCHD5Q9BSY4 110 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 RETNQ9HD89 108 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.69□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 NACAE9PAV3 2078 aa3.68□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 A0A096LPF7 62 aa3.68□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 RBX1P62877 108 aa3.68□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.68□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.68□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 NDUFAF8A1L188 74 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 K7EP34 96 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 NDUFA1O15239 70 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TIMM17BO60830 172 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 SPANXCQ9NY87 97 aa3.67□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TMEM238C9JI98 176 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TMEM262E9PQX1 116 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 APOMO95445 188 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 LELP1Q5T871 98 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 SPCS1Q9Y6A9 102 aa3.66□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
TRDN-205ENST00000546248 TSPAN13O95857 204 aa3.65□□□□□ -1.83
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TRDN-205ENST00000546248 MIAQ16674 131 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 LYPD5Q6UWN5 251 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 C5orf38Q86SI9 138 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 COX7B2Q8TF08 81 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.65□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 A0A0B4J2C4 111 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 A0A0J9YWU9 116 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 H3BNG1 76 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 K7EIL1 84 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 IFITM1P13164 125 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 HERV-K104P63124 156 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 SS18Q15532 418 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 Q6ZVQ6 151 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.64□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 A0A0U1RRA0 63 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 NPC2P61916 151 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 REG3AQ06141 175 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 KIAA0087Q14695 138 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 ENHOQ6UWT2 76 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 DAND5Q8N907 189 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 Q8NBF4 154 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 PRO0461Q9UI25 63 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 ERG28Q9UKR5 140 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.63□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 ANGP03950 147 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 XCL1P47992 114 aa3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
TRDN-205ENST00000546248 ESRGQ1W209 222 aa3.62□□□□□ -1.83
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