RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 APOC4P55056 127 aa5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 MDFIQ99750 246 aa5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM17BO60830 172 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM141Q96I45 108 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFC1O43677 76 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 CCKP06307 115 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf197Q8N268 126 aa5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.15□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP10-11P60412 298 aa5.15□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 KLKP1Q107X0 134 aa5.15□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.15□□□□□ -1.58
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC4Q99102 2169 aa5.15□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 COX7A2LO14548 114 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAL4O96015 105 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 C16orf74Q96GX8 76 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 IGIPA6NJ69 53 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 M0R381 172 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 ANK2Q01484 3957 aa5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WVE0 104 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0J9YXY3 114 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 PAX4O43316 350 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 SS18Q15532 418 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMM17AQ99595 171 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R17O96001 155 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF876PQ49A33 203 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 HTN1P15515 57 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 MIAQ16674 131 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 VWFP04275 2813 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 LITAFQ99732 161 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 STAB1Q9NY15 2570 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 TSHBP01222 138 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 XP32Q5T750 250 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 C22orf24Q9Y442 160 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 X6R8D5 127 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 MIFP14174 115 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00315P59091 139 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 COL6A5A8TX70 2615 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 NACAE9PAV3 2078 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 PRM2P04554 102 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 MGPP08493 103 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB135Q30KP9 77 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00846Q9NV44 126 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 F8WEM9 126 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL28P46779 137 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 Q9UF83 564 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-211ENST00000493660 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.09□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 LYRM9A8MSI8 78 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WWL8 130 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 DAD1P61803 113 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TM2D3Q9BRN9 247 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 Q6ZTI0 123 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 Q8NAQ8 132 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 F5H697 171 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EIL1 84 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-53P01767 116 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 M0QY20 66 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-211ENST00000493660 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.06□□□□□ -1.6
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