RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 SPTA1P02549 2419 aa-0.79□□□□□ -2.54
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PRPF40A-208ENST00000472760 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.8□□□□□ -2.54
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PRPF40A-208ENST00000472760 ATRQ13535 2644 aa-0.81□□□□□ -2.54
PRPF40A-208ENST00000472760 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa-0.81□□□□□ -2.54
PRPF40A-208ENST00000472760 LINC00846Q9NV44 126 aa-0.81□□□□□ -2.54
PRPF40A-208ENST00000472760 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.82□□□□□ -2.54
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PRPF40A-208ENST00000472760 IQSEC2Q5JU85 1478 aa-0.84□□□□□ -2.54
PRPF40A-208ENST00000472760 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-0.84□□□□□ -2.54
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PRPF40A-208ENST00000472760 H7BZZ5 65 aa-1.05□□□□□ -2.58
PRPF40A-208ENST00000472760 MPC2O95563 127 aa-1.05□□□□□ -2.58
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PRPF40A-208ENST00000472760 HERC1Q15751 4861 aa-1.05□□□□□ -2.58
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PRPF40A-208ENST00000472760 PCNX1Q96RV3 2341 aa-1.07□□□□□ -2.58
PRPF40A-208ENST00000472760 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-1.07□□□□□ -2.58
PRPF40A-208ENST00000472760 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa-1.08□□□□□ -2.58
PRPF40A-208ENST00000472760 ATOX1O00244 68 aa-1.08□□□□□ -2.58
PRPF40A-208ENST00000472760 S100PP25815 95 aa-1.08□□□□□ -2.58
PRPF40A-208ENST00000472760 SPRR2AP35326 72 aa-1.08□□□□□ -2.58
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PRPF40A-208ENST00000472760 CCL22O00626 93 aa-1.09□□□□□ -2.58
PRPF40A-208ENST00000472760 MT-ATP8P03928 68 aa-1.09□□□□□ -2.58
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