RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470482.5

HDLBP-232, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 624 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-232ENST00000470482 H0Y9J4 135 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 G0S2P27469 103 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 HERVK_113P63121 156 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 SEC11AP67812 179 aa7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 A0A096LNJ9 63 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 DIRC1Q969H9 104 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 CST9LQ9H4G1 147 aa7.05□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 LPAP08519 4548 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 M0QXV9 152 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 LINC01549A6NIU2 74 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 F8VRH5 84 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 COX19Q49B96 90 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 C22orf24Q9Y442 160 aa7.03□□□□□ -1.28
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 PRSS2P07478 247 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 CKS1BP61024 79 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 COMMD7Q86VX2 200 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00469Q8N7U9 141 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF861PO60384 105 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 CXCL5P42830 114 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 PMVKQ15126 192 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 RHEBQ15382 184 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 IGLC3P0DOY3 106 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 S100PP25815 95 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 COX7B2Q8TF08 81 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 YPEL4Q96NS1 127 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.98□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.98□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 NUPR1O60356 82 aa6.97□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00167Q96N53 147 aa6.97□□□□□ -1.29
HDLBP-232ENST00000470482 SPINK8P0C7L1 97 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00614P0C842 121 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 UBE2BP63146 152 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 FA2HQ7L5A8 372 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 BCE1O60756 84 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 Q8NDZ9 215 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 A0A087X002 238 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 VPREB1P12018 145 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 C11orf86A6NJI1 115 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 H3BRM9 83 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 HBDP02042 147 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 PMCHL1Q16048 86 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 RAB5BP61020 215 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.9□□□□□ -1.3
HDLBP-232ENST00000470482 SCO1O75880 301 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 ATP5LO75964 103 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 APOC3P02656 99 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 COX17Q14061 63 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 MUC2Q02817 5179 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 BAGE3Q86Y29 109 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 SVBPQ8N300 66 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 ERG28Q9UKR5 140 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 GAGE10A6NGK3 116 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 SNAPINO95295 136 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM223A0PJW6 202 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 PFN2P35080 140 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 M0R378 163 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFA6P56556 154 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 LINC00310P59036 64 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 CRYGAP11844 174 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM126AQ9H061 195 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-232ENST00000470482 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 TMEM238C9JI98 176 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 IGKV2D-28P01615 120 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-232ENST00000470482 NDUFA5Q16718 116 aa6.83□□□□□ -1.32
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