RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 HERC1Q15751 4861 aa4.4□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A096LNJ9 63 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00310P59036 64 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC61GP60059 68 aa4.39□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.39□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 APOMO95445 188 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 PMCHL1Q16048 86 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 COX19Q49B96 90 aa4.37□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf82Q6UX34 121 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 SVBPQ8N300 66 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10D4PQ8NGN7 298 aa4.37□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.37□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM168BA1KXE4 195 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 SNAPINO95295 136 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 MT-ND6P03923 174 aa4.36□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZRP5 223 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 NPSP0C0P6 89 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00614P0C842 121 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZN92 141 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 FA2HQ7L5A8 372 aa4.35□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.35□□□□□ -1.71
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RABGEF1-206ENST00000461017 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.34□□□□□ -1.71
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.33□□□□□ -1.72
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RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 MT1HL1P0DM35 61 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA5Q16718 116 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE2EQ4V326 116 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
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RABGEF1-206ENST00000461017 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 NUPR1O60356 82 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 TRGC2P03986 189 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK8P0C7L1 97 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 G0S2P27469 103 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 HERVK_113P63121 156 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP4.32□□□□□ -1.72
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RABGEF1-206ENST00000461017 Q8IZM0 81 aa4.32□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 COLCA2A8K830 154 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SCO1O75880 301 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 OXTP01178 125 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 HBDP02042 147 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLC3P0DOY3 106 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 S100A1P23297 94 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA6P56556 154 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 C7orf33Q8WU49 177 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.31□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf86A6NJI1 115 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC11AP67812 179 aa4.3□□□□□ -1.72
RABGEF1-206ENST00000461017 C5orf47Q569G3 176 aa4.3□□□□□ -1.72
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