RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa15.79■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOMM6Q96B49 74 aa15.78■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa15.77■□□□□ 0.12
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1644Q3SXP7 199 aa15.76■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 F8VRH5 84 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 XAGE1AQ9HD64 81 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C22orf24Q9Y442 160 aa15.75■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLLU1Q5K131 121 aa15.74■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERASQ7Z444 233 aa15.73■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCGB3A1Q96QR1 104 aa15.73■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCL5P42830 114 aa15.71■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LPAP08519 4548 aa15.71■□□□□ 0.11
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUPR1O60356 82 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF861PO60384 105 aa15.7■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADCYAP1P18509 176 aa15.69■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMIM1B2RUZ4 78 aa15.67■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UQCC3Q6UW78 93 aa15.67■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa15.66■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM218A2RU14 115 aa15.66■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01549A6NIU2 74 aa15.66■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDZD11Q5EBL8 140 aa15.66■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TP73-AS1Q9UF72 201 aa15.66■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX7B2Q8TF08 81 aa15.65■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNB1LQ9BYB4 327 aa15.65■□□□□ 0.1
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 S100PP25815 95 aa15.64■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.63■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC01546A6NGU7 62 aa15.63■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CST9LQ9H4G1 147 aa15.62■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCE1O60756 84 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPINK8P0C7L1 97 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL28P46779 137 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEC11CQ9BY50 192 aa15.59■□□□□ 0.09
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMVKQ15126 192 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FA2HQ7L5A8 372 aa15.58■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX19Q49B96 90 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00167Q96N53 147 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMCO4Q9NRQ5 59 aa15.57■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL37AP8A6NKH3 93 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB5BP61020 215 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRR4Q16378 134 aa15.56■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FABP9Q0Z7S8 132 aa15.54■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GAGE10A6NGK3 116 aa15.53■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H3BRM9 83 aa15.53■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFITM2Q01629 132 aa15.53■□□□□ 0.08
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa15.51■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP5LO75964 103 aa15.51■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKAPP1Q8N9T2 125 aa15.51■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A087X002 238 aa15.48■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN13O95857 204 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLC3P0DOY3 106 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CRYGAP11844 174 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COMMD7Q86VX2 200 aa15.47■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NDUFA6P56556 154 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPS10P5Q9NQ39 176 aa15.46■□□□□ 0.07
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PFN2P35080 140 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UBE2AP49459 152 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RHEBQ15382 184 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TYMSOSQ8TAI1 123 aa15.45■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A096LNJ9 63 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf91Q5T1B1 145 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa15.43■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa15.41■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SCO1O75880 301 aa15.41■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV2D-28P01615 120 aa15.41■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00614P0C842 121 aa15.4■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C18orf32Q8TCD1 76 aa15.4■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa15.4■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ANAPC11Q9NYG5 84 aa15.4■□□□□ 0.06
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HBDP02042 147 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ERG28Q9UKR5 140 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa15.39■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa15.38■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPREB1P12018 145 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COX17Q14061 63 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PMCHL1Q16048 86 aa15.36■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RPL24P83731 157 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa15.35■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM229BQ4G0N7 80 aa15.34■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf86A6NJI1 115 aa15.33■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAGE3Q86Y29 109 aa15.33■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRLHP81277 87 aa15.32■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM170BQ5T4T1 132 aa15.32■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SFTA2Q6UW10 78 aa15.32■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM126AQ9H061 195 aa15.32■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM238C9JI98 176 aa15.31■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa15.31■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC2Q02817 5179 aa15.29■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LINC00304Q8N9R0 145 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q8NDZ9 215 aa15.27■□□□□ 0.04
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 M0R378 163 aa15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms