RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429595.1

PTPRK-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 558 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 NDUFAF8A1L188 74 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 C11orf86A6NJI1 115 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 H0Y8G0 127 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 M0QY20 66 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 GNRH2O43555 120 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 CRYGDP07320 174 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB130BP0DP73 79 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 DEFB130AP0DP74 79 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 NMUP48645 174 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 BAALCQ8WXS3 180 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 UPK3BQ9BT76 320 aa4.12□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.12□□□□□ -1.75
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PTPRK-211ENST00000429595 ZNF688P0C7X2 276 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP10-8P60410 259 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 HERVK_113P61574 105 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 RRN3P1Q2M238 152 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 AMTNQ6UX39 209 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
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PTPRK-211ENST00000429595 LINC01600Q96MT4 127 aa4.11□□□□□ -1.75
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PTPRK-211ENST00000429595 A8MWV9 139 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 H3BUT2 72 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 I3L3M4 83 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 M0QXV9 152 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 PSCAO43653 123 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 TSHBP01222 138 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 FXYD7P58549 80 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZVH6 145 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 SLC25A29Q8N8R3 303 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 SPXQ9BT56 116 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 LRP2P98164 4655 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRK-211ENST00000429595 UBE2D1P51668 147 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRK-211ENST00000429595 ESRGQ1W209 222 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZQT7 251 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRK-211ENST00000429595 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.09□□□□□ -1.75
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PTPRK-211ENST00000429595 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-211ENST00000429595 LEPROTO15243 131 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 LYRM7Q5U5X0 104 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-211ENST00000429595 AMELXQ99217 191 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 HIST1H4GQ99525 98 aa4.08□□□□□ -1.76
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PTPRK-211ENST00000429595 TIMM21Q9BVV7 248 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 MUC2Q02817 5179 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 A0A0J9YXY3 114 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 H7C423 109 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 M0R2P5 195 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 MGPP08493 103 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 SCGB1A1P11684 91 aa4.07□□□□□ -1.76
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PTPRK-211ENST00000429595 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TMEM223A0PJW6 202 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TIMM17BO60830 172 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-53P01767 116 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-30P01768 117 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 Q6ZRU5 148 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 SCXQ7RTU7 201 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.06□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.05□□□□□ -1.76
PTPRK-211ENST00000429595 ZNF815PA8K554 130 aa4.05□□□□□ -1.76
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