RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405333.5

ODC1-202, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ODC1, Length 1,943 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-202ENST00000405333 C10orf25Q5T742 122 aa13.31□□□□□ -0.28
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ODC1-202ENST00000405333 CKS1BP61024 79 aa13.31□□□□□ -0.28
ODC1-202ENST00000405333 HSD52Q0P140 79 aa13.31□□□□□ -0.28
ODC1-202ENST00000405333 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.31□□□□□ -0.28
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ODC1-202ENST00000405333 RAB37Q96AX2 223 aa13.11□□□□□ -0.31
ODC1-202ENST00000405333 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.11□□□□□ -0.31
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ODC1-202ENST00000405333 Q6ZRP5 223 aa13.07□□□□□ -0.32
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ODC1-202ENST00000405333 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa13.05□□□□□ -0.32
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ODC1-202ENST00000405333 DNAH17Q9UFH2 4485 aa13.05□□□□□ -0.32
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ODC1-202ENST00000405333 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
ODC1-202ENST00000405333 A0A087WTM6 91 aa13.04□□□□□ -0.32
ODC1-202ENST00000405333 PRR3P79522 188 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
ODC1-202ENST00000405333 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa13.03□□□□□ -0.32
ODC1-202ENST00000405333 IGKV2D-28P01615 120 aa13.03□□□□□ -0.32
ODC1-202ENST00000405333 CNBPP62633 177 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
ODC1-202ENST00000405333 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.02□□□□□ -0.32
ODC1-202ENST00000405333 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
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