RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 GGNQ86UU5 652 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8NAQ8 132 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 CNFNQ9BYD5 112 aa4.68□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 SOCS3O14543 225 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01560Q8TB33 94 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 MYO9AB2RTY4 2548 aa4.67□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV3-20P01619 116 aa4.66□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-23P01764 117 aa4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 SMIM2Q9BVW6 85 aa4.65□□□□□ -1.66
RABGEF1-202ENST00000380828 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WYN8 130 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1-69P01742 117 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 C17orf58Q2M2W7 97 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa4.65□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 CYSRT1A8MQ03 144 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 CLPSL1A2RUU4 121 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 ROMO1P60602 79 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 HAMPP81172 84 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 TNP2Q05952 138 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 CSAG1Q6PB30 78 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 SLPIP03973 132 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 GNLYP22749 145 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 MIAQ16674 131 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.64□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 UBL5Q9BZL1 73 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 CRPP02741 224 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 C9orf106Q8NAJ2 232 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 P0C880 135 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZR54 194 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.63□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 BPY2O14599 106 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 PPP1R17O96001 155 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV1-17P01599 117 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 ERC2-IT1O76042 136 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.62□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 M0R2N4 97 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 LIMD2Q9BT23 127 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 PRAC2D3DTV9 90 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 C22orf34Q6ZV56 151 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 PDZD2O15018 2839 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0J9YX75 114 aa4.61□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV2-23P01705 113 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 B9D2Q9BPU9 175 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 OCR1Q9BZK8 76 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 TLN2Q9Y4G6 2542 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINK7P58062 85 aa4.6□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.59□□□□□ -1.67
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BRN7 92 aa4.59□□□□□ -1.67
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RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PNM2 257 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM190Q8WZ59 177 aa4.58□□□□□ -1.68
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RABGEF1-202ENST00000380828 CASC2Q6XLA1 102 aa4.58□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV1-47P01700 117 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 TTTY12Q9BZ98 90 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 LECT2O14960 151 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8N9L7 120 aa4.57□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 CR1P17927 2039 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 I3L2K1 104 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 LYSTQ99698 3801 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.56□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 LRBAP50851 2863 aa4.55□□□□□ -1.68
RABGEF1-202ENST00000380828 PRR9Q5T870 116 aa4.55□□□□□ -1.68
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