RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 BAALC-AS2P0C853 105 aa14.33□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 ATOX1O00244 68 aa14.32□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 TIRAPP58753 221 aa14.32□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa14.32□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 RETNQ9HD89 108 aa14.32□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa14.32□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZTI0 123 aa14.32□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 OVOL2Q9BRP0 275 aa14.31□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0U1RRA0 63 aa14.31□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa14.3□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa14.3□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 RS1O15537 224 aa14.3□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 NACAE9PAV3 2078 aa14.3□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 Q8NAQ8 132 aa14.3□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 Q9UF83 564 aa14.3□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa14.3□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB4AO15263 64 aa14.29□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 MIFP14174 115 aa14.29□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 TIMM17BO60830 172 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP14.28□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa14.28□□□□□ -0.12
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.27□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 DPH3Q96FX2 82 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 C22orf24Q9Y442 160 aa14.26□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 INAFM2P0DMQ5 153 aa14.25□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZSN1 163 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 MRAPQ8TCY5 172 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 DSCR8Q96T75 97 aa14.24□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 FAM222AQ5U5X8 452 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 NDUFA1O15239 70 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM258P61165 79 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa14.23□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 Q9HAA7 133 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 TRGV2A0A075B6R0 118 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-53P01767 116 aa14.22□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB130BP0DP73 79 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB130AP0DP74 79 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 C4orf26Q17RF5 130 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 Q9H8V8 135 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 LYRM9A8MSI8 78 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 OXTP01178 125 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 CELA1Q9UNI1 258 aa14.21□□□□□ -0.13
UBE2B-201ENST00000265339 TM2D3Q9BRN9 247 aa14.2□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.2□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa14.2□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 TENM3Q9P273 2699 aa14.2□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.19□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 SERP2Q8N6R1 65 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087WVE0 104 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 DNAL4O96015 105 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 MALP21145 153 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 HRCT1Q6UXD1 115 aa14.18□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 UPK3BQ9BT76 320 aa14.16□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 F5H768 121 aa14.15□□□□□ -0.14
UBE2B-201ENST00000265339 C14orf132Q9NPU4 83 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 DAD1P61803 113 aa14.14□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 COX6A2Q02221 97 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0J9YWU9 116 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 FHL2Q14192 279 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 COPS9Q8WXC6 57 aa14.13□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 USP17L23D6RBM5 183 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 Q5XG85 94 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 B9D2Q9BPU9 175 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00846Q9NV44 126 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 K7EQD1 137 aa14.11□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 Q6JHZ5 121 aa14.1□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.1□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.1□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa14.09□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa14.09□□□□□ -0.15
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa14.08□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.07□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.07□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.06□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa14.06□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 COL7A1Q02388 2944 aa14.05□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 A0A087WYN8 130 aa14.05□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 HTN3P15516 51 aa14.04□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 LINC00242Q5T6M2 205 aa14.04□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.03□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 CRPP02741 224 aa14.03□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 PRO0255Q9UI72 69 aa14.03□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 Q6ZTC4 211 aa14.03□□□□□ -0.16
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 286 ms