RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZSN1 163 aa12.6□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa12.59□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV2D-28P01615 120 aa12.59□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SLPIP03973 132 aa12.59□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 C19orf54Q5BKX5 351 aa12.59□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.58□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01560Q8TB33 94 aa12.58□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 COL6A6A6NMZ7 2263 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 IGSF10Q6WRI0 2623 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 H0YGX0 51 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 ZFHX3Q15911 3703 aa12.56□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 BCE1O60756 84 aa12.56□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa12.56□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 CFAP46Q8IYW2 2715 aa12.55□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 PMAIP1Q13794 54 aa12.54□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 A0A1W2PRX2 142 aa12.54□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 CFHR3Q02985 330 aa12.53□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 BLCAPP62952 87 aa12.53□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 MPLKIPQ8TAP9 179 aa12.53□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 MOB4Q9Y3A3 225 aa12.52□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 FAM229BQ4G0N7 80 aa12.52□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.52□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 PRM2P04554 102 aa12.51□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 USMG5Q96IX5 58 aa12.51□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.51□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 EPG5Q9HCE0 2579 aa12.5□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 SORL1Q92673 2214 aa12.5□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.49□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 TRAV10A0A0B4J240 114 aa12.48□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 NDUFC1O43677 76 aa12.48□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa12.47□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 Q96MF0 132 aa12.47□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 UBL5Q9BZL1 73 aa12.47□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 GRNP28799 593 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
GLIS1-202ENST00000628545 CCL18P55774 89 aa12.46□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00158P58513 81 aa12.46□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 IGHV3-53P01767 116 aa12.45□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 K7EMT4 169 aa12.44□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 PRR15Q8IV56 129 aa12.44□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.44□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.44□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 K7EQG2 157 aa12.43□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.43□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.43□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZRU5 148 aa12.43□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 H3BUA1 57 aa12.42□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 C1orf158Q8N1D5 194 aa12.42□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 RETNQ9HD89 108 aa12.42□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 PAX4O43316 350 aa12.41□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 ADORA2A-AS1P86434 159 aa12.41□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 COX7B2Q8TF08 81 aa12.41□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 PLAC8L1A1L4L8 177 aa12.41□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 LY6EQ16553 131 aa12.41□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 MIFP14174 115 aa12.4□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZTI0 123 aa12.4□□□□□ -0.42
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa12.39□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa12.39□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 AKAP6Q13023 2319 aa12.39□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.38□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 TM2D3Q9BRN9 247 aa12.38□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP12.37□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 CD164Q04900 197 aa12.37□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 LINC00167Q96N53 147 aa12.37□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 COL12A1Q99715 3063 aa12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 BRD3OSQ6XYD6 125 aa12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 FLNCQ14315 2725 aa12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 GNLYP22749 145 aa12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 ESRGQ1W209 222 aa12.35□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 IGLV1-40P01703 118 aa12.35□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.35□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.34□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa12.34□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 Q8N814 137 aa12.34□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 LY6G6DO95868 133 aa12.33□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 PRB1P04280 392 aa12.33□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 HAMPP81172 84 aa12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087WZ39 114 aa12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 Q8N3U1 123 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM254Q8TBM7 123 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.3□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 K7EQD1 137 aa12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.1 ms