RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 Q6ZSN1 163 aa12.6□□□□□ -0.39
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GLIS1-202ENST00000628545 IGKV2D-28P01615 120 aa12.59□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 SLPIP03973 132 aa12.59□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 C19orf54Q5BKX5 351 aa12.59□□□□□ -0.39
GLIS1-202ENST00000628545 BPESC1Q9GZL8 116 aa12.58□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 LINC01560Q8TB33 94 aa12.58□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 COL6A6A6NMZ7 2263 aa12.57□□□□□ -0.4
GLIS1-202ENST00000628545 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa12.57□□□□□ -0.4
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GLIS1-202ENST00000628545 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa12.51□□□□□ -0.41
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GLIS1-202ENST00000628545 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.49□□□□□ -0.41
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GLIS1-202ENST00000628545 C11orf71Q6IPW1 123 aa12.38□□□□□ -0.43
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GLIS1-202ENST00000628545 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa12.34□□□□□ -0.43
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GLIS1-202ENST00000628545 Q8N814 137 aa12.34□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 LY6G6DO95868 133 aa12.33□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 PRB1P04280 392 aa12.33□□□□□ -0.43
GLIS1-202ENST00000628545 HAMPP81172 84 aa12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 A0A087WZ39 114 aa12.33□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP12.32□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 Q8N3U1 123 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 MYO18BQ8IUG5 2567 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 TMEM254Q8TBM7 123 aa12.31□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.3□□□□□ -0.44
GLIS1-202ENST00000628545 K7EQD1 137 aa12.3□□□□□ -0.44
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